More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_09450 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_09450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 268 aa  521  1e-147  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  46.81 
 
 		 233 aa  186  5e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1502  Methyltransferase type 12  39.42 
 
 		 223 aa  142  8e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1197  Methyltransferase type 12  39.63 
 
 		 289 aa  138  7.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1258  hypothetical protein  40.7 
 
 		 238 aa  119  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.22 
 
 		 200 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  35.44 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  34.84 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  33.79 
 
 		 198 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  33.64 
 
 		 203 aa  93.6  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.36 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  30.97 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.85 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  41.59 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.62 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  39.62 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.83 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  35.83 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  40.59 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  35 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.61 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 232 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.67 
 
 		 229 aa  54.7  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.15 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 232 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  30.58 
 
 		 206 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2495  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.33 
 
 		 238 aa  54.7  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3361  methyltransferase type 12  38.46 
 
 		 222 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313906  normal  0.784273 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.28 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  39 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.15 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  36.54 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.15 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.37 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.37 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 247 aa  53.5  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.74 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.74 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.74 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.74 
 
 		 251 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2592  hypothetical protein  38.02 
 
 		 220 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1258  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 245 aa  52.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.760119 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.33 
 
 		 229 aa  52.8  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 310 aa  52.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.94 
 
 		 232 aa  52.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2169  hypothetical protein  37.5 
 
 		 223 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.21 
 
 		 246 aa  52.8  0.000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3011  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.88 
 
 		 232 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573417  normal  0.0163533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  34.95 
 
 		 242 aa  52.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 358 aa  52  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.09 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.88 
 
 		 232 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.61 
 
 		 345 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5352  methyltransferase type 11  35 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  33.33 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.89 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  37.82 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.16 
 
 		 229 aa  51.6  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.93 
 
 		 235 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.81 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.34 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1773  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.15 
 
 		 265 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0972  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.15 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00675133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.45 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.21 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  33.33 
 
 		 247 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  33.63 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0356  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.859142  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.2 
 
 		 238 aa  50.8  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.21 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 		 225 aa  50.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.68 
 
 		 236 aa  50.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 341 aa  49.7  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  29.31 
 
 		 204 aa  49.3  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2150  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.08 
 
 		 236 aa  49.3  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 265 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  32.8 
 
 		 202 aa  49.3  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 259 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 295 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54050  hypothetical protein  31.97 
 
 		 221 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.95 
 
 		 236 aa  48.9  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0736  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.94 
 
 		 232 aa  48.9  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4088  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  30.7 
 
 		 541 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.09 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  39.83 
 
 		 267 aa  48.5  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.12 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.23 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>