More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3267 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  100 
 
 
305 aa  637    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  56.96 
 
 
262 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  56.96 
 
 
262 aa  280  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  57.52 
 
 
254 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  54.82 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  57.96 
 
 
257 aa  272  6e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  57.08 
 
 
254 aa  271  1e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  56.14 
 
 
251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  54.82 
 
 
251 aa  265  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  52.59 
 
 
253 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  52.89 
 
 
253 aa  258  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  50.64 
 
 
255 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  53.91 
 
 
253 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3894  methyltransferase type 11  53.07 
 
 
257 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  53.48 
 
 
253 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  51.77 
 
 
262 aa  229  4e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  50.22 
 
 
262 aa  228  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0040  hypothetical protein  30.54 
 
 
249 aa  92.8  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3708  hypothetical protein  27.84 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0409  hypothetical protein  29 
 
 
251 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  28.09 
 
 
285 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1481  putative methyltransferase  32.81 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4745  hypothetical protein  32.79 
 
 
322 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211632  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54270  hypothetical protein  34.24 
 
 
322 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4583  methyltransferase, putative  31.94 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1077  methyltransferase  31.22 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1440  methyltransferase, putative  29.61 
 
 
318 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4281  putative methyltransferase  29.61 
 
 
318 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14238  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13850  methyltransferase  31.15 
 
 
319 aa  62.8  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3947  methyltransferase, putative  29.21 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4213  methyltransferase, putative  28.71 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.987743  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0811  hypothetical protein  37.08 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956918  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4367  methyltransferase  28.67 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.038567 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0848  Generic methyltransferase  25.85 
 
 
296 aa  60.5  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02157  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase domain  28.69 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675721  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
242 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0272  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  30.06 
 
 
321 aa  59.7  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2578  methyltransferase  33.57 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000179081  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2120  putative methyltransferase  30.32 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000230478 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2531  methyltransferase, putative  28.37 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149283 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2060  putative methyltransferase  30.32 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.710945 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1341  putative methyltransferase  30.32 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  hitchhiker  0.00030781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2065  putative methyltransferase  30.32 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1217  putative methyltransferase  30.32 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2436  methyltransferase, putative  31.62 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2082  putative methyltransferase  31.13 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0434288  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1345  methyltransferase putative  32.97 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1895  putative methyltransferase  31.62 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.175832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2083  putative methyltransferase  31.62 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.018552  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  28.91 
 
 
244 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1950  putative methyltransferase  31.62 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2763  putative methyltransferase  26.95 
 
 
330 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.516525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01842  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  30.67 
 
 
323 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1769  methyltransferase  30.67 
 
 
323 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849085  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1315  putative methyltransferase  30.67 
 
 
323 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2102  putative methyltransferase  30.67 
 
 
323 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01830  hypothetical protein  30.67 
 
 
323 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2164  putative methyltransferase  30.67 
 
 
323 aa  56.2  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.96989  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.06 
 
 
234 aa  56.2  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2607  putative methyltransferase  30.67 
 
 
323 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  0.116938 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1761  methyltransferase  30.67 
 
 
323 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1965  putative methyltransferase  30.67 
 
 
323 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0566  methyltransferase, putative  28.3 
 
 
291 aa  56.2  0.0000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2027  putative methyltransferase  27.96 
 
 
330 aa  56.2  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1890  methyltransferase, putative  28.27 
 
 
330 aa  56.2  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000006524  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.25 
 
 
243 aa  56.2  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001055  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  38.64 
 
 
214 aa  55.8  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.829142  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2790  methyltransferase, putative  32.85 
 
 
324 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383321  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2111  putative methyltransferase  34.85 
 
 
322 aa  55.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2369  putative methyltransferase  27.46 
 
 
330 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.43 
 
 
232 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1932  putative methyltransferase  30.88 
 
 
332 aa  55.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2037  methyltransferase  30.88 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0212649  hitchhiker  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4026  putative methyltransferase  32.09 
 
 
323 aa  55.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  35.79 
 
 
211 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8763  hypothetical protein  24.24 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.613502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2035  putative methyltransferase  30.88 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0697  putative methyltransferase  26.32 
 
 
328 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2426  putative methyltransferase  30.88 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487881  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2310  putative methyltransferase  30.88 
 
 
331 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0805655  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  25.89 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.36 
 
 
247 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  39.53 
 
 
251 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0121  hypothetical protein  31.4 
 
 
298 aa  54.7  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2430  hypothetical protein  29.03 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.116007 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0080  SAM-dependent methyltransferase  25.83 
 
 
324 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00112476  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.19 
 
 
242 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2152  methyltransferase  29.03 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.99 
 
 
240 aa  55.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  31.15 
 
 
237 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1846  methyltransferase, putative  34.15 
 
 
330 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.528406  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2039  putative methyltransferase  29.03 
 
 
323 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  29.25 
 
 
395 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
273 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2439  putative methyltransferase  30 
 
 
323 aa  54.3  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1676  hypothetical protein  28.47 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.28 
 
 
247 aa  54.3  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  37.78 
 
 
278 aa  53.9  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11549  hypothetical protein  30.36 
 
 
298 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.86 
 
 
240 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.970873 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>