146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1676 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1676  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  548  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  29.53 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 262 aa  62  0.000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  32.12 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  26.29 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02157  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase domain  24.42 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2111  putative methyltransferase  29.41 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 305 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  26.18 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4367  methyltransferase  27.87 
 
 		 318 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1440  methyltransferase, putative  27.81 
 
 		 318 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 253 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4281  putative methyltransferase  27.27 
 
 		 318 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2436  methyltransferase, putative  27.33 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2037  methyltransferase  29.14 
 
 		 331 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0212649  hitchhiker  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1932  putative methyltransferase  29.14 
 
 		 332 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2310  putative methyltransferase  29.14 
 
 		 331 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0805655  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2426  putative methyltransferase  29.14 
 
 		 331 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487881  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0272  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  25.81 
 
 		 321 aa  50.4  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2035  putative methyltransferase  29.14 
 
 		 331 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4628  MCP methyltransferase, CheR-type  30.61 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2439  putative methyltransferase  24.6 
 
 		 323 aa  49.7  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2790  methyltransferase, putative  26.63 
 
 		 324 aa  49.7  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383321  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4213  methyltransferase, putative  25 
 
 		 319 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.987743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2763  putative methyltransferase  26.46 
 
 		 330 aa  49.7  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.516525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3947  methyltransferase, putative  25 
 
 		 319 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2881  methyltransferase  25.41 
 
 		 323 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000222337 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1846  methyltransferase, putative  27.66 
 
 		 330 aa  49.3  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.528406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2670  methyltransferase  25.41 
 
 		 323 aa  49.3  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  29.11 
 
 		 217 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1895  putative methyltransferase  26.67 
 
 		 330 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.175832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2083  putative methyltransferase  26.67 
 
 		 330 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.018552  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1950  putative methyltransferase  26.67 
 
 		 330 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4583  methyltransferase, putative  26.74 
 
 		 318 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01594  methyltransferase  25.33 
 
 		 323 aa  48.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0409  hypothetical protein  24.15 
 
 		 251 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003929  tRNA (5-methoxyuridine) 34 synthase  25 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00210133  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0732  hypothetical protein  25.33 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000183098  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11549  hypothetical protein  29.17 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2787  putative methyltransferase  23.4 
 
 		 323 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1402  methyltransferase  24.06 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183467  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01842  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  23.65 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1769  methyltransferase  23.65 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849085  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1884  putative methyltransferase  25 
 
 		 324 aa  47  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2607  putative methyltransferase  23.65 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  0.116938 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01830  hypothetical protein  23.65 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0697  putative methyltransferase  25.13 
 
 		 328 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2164  putative methyltransferase  23.65 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.96989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1965  putative methyltransferase  23.65 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2102  putative methyltransferase  23.65 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2369  putative methyltransferase  24.32 
 
 		 330 aa  47.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122535  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1761  methyltransferase  23.65 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1315  putative methyltransferase  23.65 
 
 		 323 aa  47  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2060  putative methyltransferase  23.65 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.710945 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2120  putative methyltransferase  23.65 
 
 		 323 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1217  putative methyltransferase  23.65 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1341  putative methyltransferase  23.65 
 
 		 323 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  hitchhiker  0.00030781 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2065  putative methyltransferase  23.65 
 
 		 323 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181149 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_5006  predicted protein  42.37 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0895863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0811  hypothetical protein  26.87 
 
 		 285 aa  46.6  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956918  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3708  hypothetical protein  22.03 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1481  putative methyltransferase  27.78 
 
 		 322 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  56.25 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1077  methyltransferase  25.13 
 
 		 318 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0848  Generic methyltransferase  25 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54270  hypothetical protein  27.78 
 
 		 322 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1075  hypothetical protein  25.93 
 
 		 282 aa  46.2  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.148018  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.2 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2531  methyltransferase, putative  23.61 
 
 		 323 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 262 aa  45.8  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2027  putative methyltransferase  25.68 
 
 		 330 aa  45.8  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  44.68 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.87 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1852  methyltransferase, putative  25.82 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.670085 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1890  methyltransferase, putative  25.68 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000006524  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2082  putative methyltransferase  25 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0434288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  44 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  25.83 
 
 		 258 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  24.39 
 
 		 246 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8763  hypothetical protein  27.08 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.613502  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0566  methyltransferase, putative  26.43 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2187  putative methyltransferase  26 
 
 		 330 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000631484  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  27.06 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4745  hypothetical protein  28.79 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2039  putative methyltransferase  23.08 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2430  hypothetical protein  23.08 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.116007 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2152  methyltransferase  24.82 
 
 		 323 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2578  methyltransferase  25.68 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000179081  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  39.22 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  39.22 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  39.22 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25153  predicted protein  28.99 
 
 		 338 aa  43.9  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00188354  hitchhiker  0.00255191 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>