197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1402 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1402  methyltransferase  100 
 
 		 323 aa  671    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2881  methyltransferase  93.17 
 
 		 323 aa  627  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000222337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2531  methyltransferase, putative  82.04 
 
 		 323 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149283 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2670  methyltransferase  78.02 
 
 		 323 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4583  methyltransferase, putative  52.17 
 
 		 318 aa  360  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3947  methyltransferase, putative  52.94 
 
 		 319 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4213  methyltransferase, putative  52.63 
 
 		 319 aa  355  5e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.987743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2436  methyltransferase, putative  51.85 
 
 		 330 aa  350  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54270  hypothetical protein  53.29 
 
 		 322 aa  349  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2027  putative methyltransferase  51.39 
 
 		 330 aa  348  7e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1890  methyltransferase, putative  51.85 
 
 		 330 aa  348  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000006524  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4745  hypothetical protein  52.66 
 
 		 322 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211632  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2578  methyltransferase  51.08 
 
 		 330 aa  346  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000179081  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2369  putative methyltransferase  50.93 
 
 		 330 aa  346  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122535  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1932  putative methyltransferase  50.31 
 
 		 332 aa  346  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1895  putative methyltransferase  50.93 
 
 		 330 aa  345  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.175832 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1950  putative methyltransferase  50.93 
 
 		 330 aa  345  5e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1077  methyltransferase  52.17 
 
 		 318 aa  345  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1846  methyltransferase, putative  51.08 
 
 		 330 aa  345  8e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.528406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2111  putative methyltransferase  50.62 
 
 		 322 aa  344  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1852  methyltransferase, putative  49.38 
 
 		 325 aa  344  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.670085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2426  putative methyltransferase  50 
 
 		 331 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487881  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2310  putative methyltransferase  50 
 
 		 331 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0805655  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2083  putative methyltransferase  50.62 
 
 		 330 aa  343  2e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.018552  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2037  methyltransferase  50 
 
 		 331 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0212649  hitchhiker  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2035  putative methyltransferase  50 
 
 		 331 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13850  methyltransferase  52.32 
 
 		 319 aa  342  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2548  methyltransferase, putative  52.65 
 
 		 333 aa  342  4e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0732  hypothetical protein  52.92 
 
 		 323 aa  342  5e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000183098  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2094  methyltransferase  49.69 
 
 		 327 aa  341  9e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1481  putative methyltransferase  52.65 
 
 		 322 aa  341  9e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2439  putative methyltransferase  51.07 
 
 		 323 aa  340  2e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2790  methyltransferase, putative  52.16 
 
 		 324 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383321  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0697  putative methyltransferase  49.85 
 
 		 328 aa  339  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4367  methyltransferase  50 
 
 		 318 aa  338  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038567 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2152  methyltransferase  50.93 
 
 		 323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2787  putative methyltransferase  50.31 
 
 		 323 aa  338  5.9999999999999996e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1440  methyltransferase, putative  49.69 
 
 		 318 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2082  putative methyltransferase  50.62 
 
 		 330 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0434288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4281  putative methyltransferase  49.38 
 
 		 318 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2039  putative methyltransferase  50.62 
 
 		 323 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2187  putative methyltransferase  50.31 
 
 		 330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000631484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2430  hypothetical protein  50.62 
 
 		 323 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.116007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2763  putative methyltransferase  49.54 
 
 		 330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.516525  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003929  tRNA (5-methoxyuridine) 34 synthase  50.15 
 
 		 323 aa  335  5e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00210133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2169  methyltransferase  50 
 
 		 323 aa  335  5e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01842  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  50 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1315  putative methyltransferase  50 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1965  putative methyltransferase  50 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01830  hypothetical protein  50 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4026  putative methyltransferase  49.22 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1761  methyltransferase  50 
 
 		 323 aa  334  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1769  methyltransferase  50 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01594  methyltransferase  49.23 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2164  putative methyltransferase  50 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.96989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2102  putative methyltransferase  50 
 
 		 323 aa  333  2e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2607  putative methyltransferase  49.69 
 
 		 323 aa  333  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  0.116938 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1217  putative methyltransferase  49.69 
 
 		 323 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1341  putative methyltransferase  49.69 
 
 		 323 aa  332  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  hitchhiker  0.00030781 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2060  putative methyltransferase  49.38 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.710945 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1810  methyltransferase  50 
 
 		 328 aa  330  1e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2065  putative methyltransferase  49.38 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2120  putative methyltransferase  49.38 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230478 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2266  methyltransferase  49.07 
 
 		 323 aa  328  8e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0272  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  49.54 
 
 		 321 aa  326  3e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1884  putative methyltransferase  48.93 
 
 		 324 aa  323  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02157  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase domain  47.53 
 
 		 332 aa  317  2e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675721  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0078  methyltransferase, putative  45.85 
 
 		 332 aa  314  9.999999999999999e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0228138  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1948  hypothetical protein  46.18 
 
 		 350 aa  304  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2241  methyltransferase, putative  44.19 
 
 		 363 aa  303  3.0000000000000004e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0291  putative methyltransferase  44.54 
 
 		 353 aa  294  2e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2394  methyltransferase  50.17 
 
 		 342 aa  292  6e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0080  SAM-dependent methyltransferase  45.69 
 
 		 324 aa  286  4e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00112476  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4909  methyltransferase, putative  36.88 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.628924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2062  hypothetical protein  38.85 
 
 		 289 aa  209  5e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.100668  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1345  methyltransferase putative  38.03 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0121  hypothetical protein  39 
 
 		 298 aa  202  8e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0848  Generic methyltransferase  38.35 
 
 		 296 aa  200  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0811  hypothetical protein  40.87 
 
 		 285 aa  195  9e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956918  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0995  methyltransferase, putative  36.51 
 
 		 291 aa  188  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1058  methyltransferase, putative  36.51 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0814  methyltransferase, putative  36.1 
 
 		 291 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.638021  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1075  hypothetical protein  37.77 
 
 		 282 aa  183  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.148018  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0566  methyltransferase, putative  32.41 
 
 		 291 aa  178  9e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3894  methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  26.86 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0040  hypothetical protein  25.56 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  29 
 
 		 248 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  27.31 
 
 		 253 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 269 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  27.31 
 
 		 253 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  28.08 
 
 		 254 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13340  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.05 
 
 		 234 aa  53.5  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.34 
 
 		 232 aa  53.5  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  27.31 
 
 		 305 aa  53.1  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>