130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2039 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2039  putative methyltransferase  100 
 
 
323 aa  664    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2430  hypothetical protein  99.69 
 
 
323 aa  663    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.116007 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2152  methyltransferase  99.38 
 
 
323 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2787  putative methyltransferase  86.38 
 
 
323 aa  584  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2094  methyltransferase  81.11 
 
 
327 aa  559  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1810  methyltransferase  82.04 
 
 
328 aa  542  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2439  putative methyltransferase  78.33 
 
 
323 aa  533  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2266  methyltransferase  78.02 
 
 
323 aa  533  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1341  putative methyltransferase  78.95 
 
 
323 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  hitchhiker  0.00030781 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1217  putative methyltransferase  78.95 
 
 
323 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2065  putative methyltransferase  78.95 
 
 
323 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2120  putative methyltransferase  78.95 
 
 
323 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000230478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2060  putative methyltransferase  78.64 
 
 
323 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.710945 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01842  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  77.09 
 
 
323 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01830  hypothetical protein  77.09 
 
 
323 aa  525  1e-148  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1965  putative methyltransferase  77.09 
 
 
323 aa  525  1e-148  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1761  methyltransferase  77.09 
 
 
323 aa  525  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1315  putative methyltransferase  77.09 
 
 
323 aa  525  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1769  methyltransferase  76.78 
 
 
323 aa  522  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2102  putative methyltransferase  76.47 
 
 
323 aa  521  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2607  putative methyltransferase  76.78 
 
 
323 aa  524  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  0.116938 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2169  methyltransferase  76.78 
 
 
323 aa  519  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2164  putative methyltransferase  75.85 
 
 
323 aa  519  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.96989  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003929  tRNA (5-methoxyuridine) 34 synthase  65.12 
 
 
323 aa  444  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00210133  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01594  methyltransferase  65.12 
 
 
323 aa  441  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0272  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  62.73 
 
 
321 aa  440  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1884  putative methyltransferase  64.2 
 
 
324 aa  438  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0732  hypothetical protein  62.96 
 
 
323 aa  429  1e-119  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000183098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0697  putative methyltransferase  59.32 
 
 
328 aa  415  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2436  methyltransferase, putative  60.25 
 
 
330 aa  408  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2082  putative methyltransferase  60.56 
 
 
330 aa  408  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0434288  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2027  putative methyltransferase  59.94 
 
 
330 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2578  methyltransferase  59.94 
 
 
330 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000179081  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1895  putative methyltransferase  59.94 
 
 
330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.175832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2083  putative methyltransferase  59.94 
 
 
330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.018552  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1950  putative methyltransferase  59.94 
 
 
330 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2369  putative methyltransferase  58.39 
 
 
330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122535  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1890  methyltransferase, putative  58.7 
 
 
330 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000006524  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2035  putative methyltransferase  59.63 
 
 
331 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1932  putative methyltransferase  59.63 
 
 
332 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2310  putative methyltransferase  59.63 
 
 
331 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0805655  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2426  putative methyltransferase  59.63 
 
 
331 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487881  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2037  methyltransferase  59.63 
 
 
331 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0212649  hitchhiker  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4026  putative methyltransferase  58.93 
 
 
323 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2111  putative methyltransferase  57.14 
 
 
322 aa  396  1e-109  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2187  putative methyltransferase  57.76 
 
 
330 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000631484  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1846  methyltransferase, putative  59.32 
 
 
330 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.528406  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02157  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase domain  52.63 
 
 
332 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675721  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1077  methyltransferase  55.42 
 
 
318 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4583  methyltransferase, putative  53.87 
 
 
318 aa  352  4e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4281  putative methyltransferase  55.42 
 
 
318 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14238  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1440  methyltransferase, putative  55.11 
 
 
318 aa  351  8e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1481  putative methyltransferase  57.64 
 
 
322 aa  349  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13850  methyltransferase  56.17 
 
 
319 aa  346  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4367  methyltransferase  53.87 
 
 
318 aa  345  5e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.038567 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1852  methyltransferase, putative  49.38 
 
 
325 aa  342  5e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.670085 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4745  hypothetical protein  55.38 
 
 
322 aa  342  5.999999999999999e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211632  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2548  methyltransferase, putative  56.05 
 
 
333 aa  340  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4213  methyltransferase, putative  52.78 
 
 
319 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.987743  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3947  methyltransferase, putative  52.78 
 
 
319 aa  338  7e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54270  hypothetical protein  54.75 
 
 
322 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1402  methyltransferase  50.62 
 
 
323 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183467  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2241  methyltransferase, putative  52.84 
 
 
363 aa  333  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2881  methyltransferase  51.42 
 
 
323 aa  331  8e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000222337 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2763  putative methyltransferase  54.4 
 
 
330 aa  331  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.516525  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0078  methyltransferase, putative  50.93 
 
 
332 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0228138  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2531  methyltransferase, putative  52.29 
 
 
323 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149283 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0291  putative methyltransferase  50.3 
 
 
353 aa  326  3e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2670  methyltransferase  50 
 
 
323 aa  326  3e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2790  methyltransferase, putative  52.35 
 
 
324 aa  325  5e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383321  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1948  hypothetical protein  52.17 
 
 
350 aa  323  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2394  methyltransferase  51.27 
 
 
342 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0080  SAM-dependent methyltransferase  46.98 
 
 
324 aa  281  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00112476  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4909  methyltransferase, putative  38.59 
 
 
326 aa  229  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.628924  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1345  methyltransferase putative  39.43 
 
 
300 aa  217  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2062  hypothetical protein  38.21 
 
 
289 aa  216  4e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.100668  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0848  Generic methyltransferase  38.71 
 
 
296 aa  216  5e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0811  hypothetical protein  36.79 
 
 
285 aa  199  6e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956918  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0121  hypothetical protein  38.15 
 
 
298 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0995  methyltransferase, putative  33.82 
 
 
291 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0814  methyltransferase, putative  33.82 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.638021  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1058  methyltransferase, putative  38.14 
 
 
291 aa  189  4e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1075  hypothetical protein  37.76 
 
 
282 aa  186  4e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.148018  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0566  methyltransferase, putative  36.1 
 
 
291 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  25.95 
 
 
255 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 
253 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  30.16 
 
 
253 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 
253 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  26.64 
 
 
262 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  26.2 
 
 
262 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  33.61 
 
 
254 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  29.1 
 
 
253 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  39 
 
 
248 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  33.61 
 
 
254 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3894  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  29.12 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3708  hypothetical protein  29.09 
 
 
241 aa  52.8  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>