109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3708 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3708  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  486  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0409  hypothetical protein  41.94 
 
 
251 aa  188  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0040  hypothetical protein  36.32 
 
 
249 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  36.73 
 
 
254 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  37.14 
 
 
254 aa  105  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  39.48 
 
 
257 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8763  hypothetical protein  35.35 
 
 
296 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.613502  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  36.44 
 
 
255 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  36.44 
 
 
253 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  36.44 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  35.22 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  35.12 
 
 
262 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  35.12 
 
 
262 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  34.12 
 
 
251 aa  90.9  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  27.84 
 
 
305 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 
262 aa  89.4  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
262 aa  89  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  32.7 
 
 
251 aa  89  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  32.97 
 
 
248 aa  85.9  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3894  methyltransferase type 11  30.2 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  26.38 
 
 
285 aa  79  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0420  hypothetical protein  43.94 
 
 
116 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00650863  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54270  hypothetical protein  31.68 
 
 
322 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4745  hypothetical protein  30.43 
 
 
322 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1077  methyltransferase  30.3 
 
 
318 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2430  hypothetical protein  29.09 
 
 
323 aa  53.1  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.116007 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2152  methyltransferase  29.09 
 
 
323 aa  53.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2039  putative methyltransferase  29.09 
 
 
323 aa  52.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0272  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  28.22 
 
 
321 aa  52.4  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1481  putative methyltransferase  29.27 
 
 
322 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2351  macrocin-O-methyltransferase  25.58 
 
 
557 aa  52  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2787  putative methyltransferase  28.05 
 
 
323 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4367  methyltransferase  29.7 
 
 
318 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.038567 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2881  methyltransferase  29.34 
 
 
323 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000222337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1440  methyltransferase, putative  29.7 
 
 
318 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2763  putative methyltransferase  28.82 
 
 
330 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.516525  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1402  methyltransferase  28.74 
 
 
323 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183467  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4213  methyltransferase, putative  29.09 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.987743  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3947  methyltransferase, putative  29.09 
 
 
319 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4583  methyltransferase, putative  29.09 
 
 
318 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2531  methyltransferase, putative  27.54 
 
 
323 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4281  putative methyltransferase  29.7 
 
 
318 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14238  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0080  SAM-dependent methyltransferase  27.91 
 
 
324 aa  49.7  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00112476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2670  methyltransferase  27.54 
 
 
323 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02157  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase domain  26.95 
 
 
332 aa  49.7  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675721  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1890  methyltransferase, putative  28.92 
 
 
330 aa  49.7  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000006524  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2164  putative methyltransferase  27.71 
 
 
323 aa  49.3  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.96989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2102  putative methyltransferase  27.11 
 
 
323 aa  48.9  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2439  putative methyltransferase  27.71 
 
 
323 aa  48.9  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2111  putative methyltransferase  26.95 
 
 
322 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1852  methyltransferase, putative  25.61 
 
 
325 aa  48.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.670085 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2062  hypothetical protein  24.7 
 
 
289 aa  48.1  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.100668  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13850  methyltransferase  29.19 
 
 
319 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01842  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  26.67 
 
 
323 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1769  methyltransferase  26.67 
 
 
323 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849085  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2094  methyltransferase  29.19 
 
 
327 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1895  putative methyltransferase  28.48 
 
 
330 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.175832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2083  putative methyltransferase  28.48 
 
 
330 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.018552  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1950  putative methyltransferase  28.48 
 
 
330 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1846  methyltransferase, putative  25.77 
 
 
330 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.528406  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0995  methyltransferase, putative  22.34 
 
 
291 aa  47.4  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0732  hypothetical protein  29.19 
 
 
323 aa  47.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000183098  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01594  methyltransferase  28.31 
 
 
323 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1965  putative methyltransferase  26.67 
 
 
323 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1761  methyltransferase  26.67 
 
 
323 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1315  putative methyltransferase  26.67 
 
 
323 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1810  methyltransferase  29.81 
 
 
328 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2033  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
672 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.593414  hitchhiker  0.00610448 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2607  putative methyltransferase  26.67 
 
 
323 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  0.116938 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01830  hypothetical protein  26.67 
 
 
323 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1058  methyltransferase, putative  22.34 
 
 
291 aa  47  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2436  methyltransferase, putative  28.48 
 
 
330 aa  47  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4026  putative methyltransferase  27.11 
 
 
323 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2035  putative methyltransferase  28.48 
 
 
331 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1932  putative methyltransferase  28.92 
 
 
332 aa  46.6  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2310  putative methyltransferase  28.48 
 
 
331 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0805655  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0814  methyltransferase, putative  22.7 
 
 
291 aa  46.6  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.638021  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2426  putative methyltransferase  28.48 
 
 
331 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487881  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2065  putative methyltransferase  26.67 
 
 
323 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2120  putative methyltransferase  26.67 
 
 
323 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000230478 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2060  putative methyltransferase  26.67 
 
 
323 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.710945 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1217  putative methyltransferase  26.67 
 
 
323 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1341  putative methyltransferase  26.67 
 
 
323 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  hitchhiker  0.00030781 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2037  methyltransferase  28.48 
 
 
331 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0212649  hitchhiker  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2548  methyltransferase, putative  26.97 
 
 
333 aa  45.8  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1676  hypothetical protein  22.03 
 
 
265 aa  46.2  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0566  methyltransferase, putative  22.99 
 
 
291 aa  46.2  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2169  methyltransferase  27.85 
 
 
323 aa  46.2  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0078  methyltransferase, putative  30.77 
 
 
332 aa  45.8  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0228138  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0697  putative methyltransferase  26.75 
 
 
328 aa  45.8  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1948  hypothetical protein  28.14 
 
 
350 aa  45.4  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2790  methyltransferase, putative  27.65 
 
 
324 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383321  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2187  putative methyltransferase  28.48 
 
 
330 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000631484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003929  tRNA (5-methoxyuridine) 34 synthase  27.11 
 
 
323 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00210133  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11549  hypothetical protein  34.78 
 
 
298 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0811  hypothetical protein  26.06 
 
 
285 aa  44.7  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956918  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1884  putative methyltransferase  27.11 
 
 
324 aa  44.7  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2394  methyltransferase  27.5 
 
 
342 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2369  putative methyltransferase  27.71 
 
 
330 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122535  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>