More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3894 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3894  methyltransferase type 11  100 
 
 		 257 aa  528  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  74.06 
 
 		 248 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  73.06 
 
 		 253 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  64.44 
 
 		 251 aa  322  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  61.26 
 
 		 251 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  60.66 
 
 		 262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  63.6 
 
 		 262 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  60.76 
 
 		 254 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  59.92 
 
 		 254 aa  297  9e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  58.75 
 
 		 255 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  64.32 
 
 		 257 aa  297  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  62.01 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  59.51 
 
 		 253 aa  292  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  59.51 
 
 		 253 aa  291  7e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  53.07 
 
 		 305 aa  256  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  53.95 
 
 		 262 aa  235  7e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  53.95 
 
 		 262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0409  hypothetical protein  29.52 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3708  hypothetical protein  30.2 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0040  hypothetical protein  29.06 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  35.09 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4745  hypothetical protein  30.14 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211632  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13850  methyltransferase  29.15 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54270  hypothetical protein  28.89 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1481  putative methyltransferase  29.55 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1077  methyltransferase  28.07 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1345  methyltransferase putative  30.19 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4583  methyltransferase, putative  27.47 
 
 		 318 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4213  methyltransferase, putative  26.46 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.987743  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3947  methyltransferase, putative  26.46 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4744  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  39.29 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.752989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0566  methyltransferase, putative  25.64 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2082  putative methyltransferase  28.02 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0434288  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1440  methyltransferase, putative  27.63 
 
 		 318 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4281  putative methyltransferase  27.63 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.19 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.19 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4367  methyltransferase  27.23 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038567 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2037  methyltransferase  27.47 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0212649  hitchhiker  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2310  putative methyltransferase  27.47 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0805655  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2426  putative methyltransferase  27.47 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487881  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2035  putative methyltransferase  27.47 
 
 		 331 aa  63.5  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2790  methyltransferase, putative  28.63 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383321  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1890  methyltransferase, putative  27.47 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000006524  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1932  putative methyltransferase  27.47 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2187  putative methyltransferase  27.07 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000631484  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 228 aa  62  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2436  methyltransferase, putative  26.92 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2578  methyltransferase  27.47 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000179081  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2062  hypothetical protein  23.66 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.100668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1402  methyltransferase  26.75 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183467  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1895  putative methyltransferase  26.92 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.175832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2083  putative methyltransferase  26.92 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.018552  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1950  putative methyltransferase  26.92 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02157  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase domain  26.07 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675721  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2763  putative methyltransferase  27.93 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.516525  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2027  putative methyltransferase  26.92 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0121  hypothetical protein  32.61 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2102  putative methyltransferase  26.43 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2607  putative methyltransferase  26.43 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  0.116938 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2164  putative methyltransferase  26.43 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.96989  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01842  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  26.43 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1761  methyltransferase  26.43 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1965  putative methyltransferase  26.43 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01830  hypothetical protein  26.43 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1315  putative methyltransferase  26.43 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2881  methyltransferase  28.38 
 
 		 323 aa  58.5  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000222337 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1769  methyltransferase  28.42 
 
 		 323 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0811  hypothetical protein  34.83 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956918  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 244 aa  58.5  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1852  methyltransferase, putative  26.84 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.670085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  39.51 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2906  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.55 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2369  putative methyltransferase  36 
 
 		 330 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122535  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0697  putative methyltransferase  24.67 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2111  putative methyltransferase  29.82 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1217  putative methyltransferase  27.87 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2060  putative methyltransferase  27.87 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.710945 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.17 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0848  Generic methyltransferase  32.98 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0814  methyltransferase, putative  31.46 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.638021  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2120  putative methyltransferase  27.87 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230478 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2065  putative methyltransferase  27.87 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181149 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  24.12 
 
 		 746 aa  57.8  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4026  putative methyltransferase  27.14 
 
 		 323 aa  57.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0272  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  28.57 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1075  hypothetical protein  29.03 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.148018  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1341  putative methyltransferase  27.87 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  hitchhiker  0.00030781 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0995  methyltransferase, putative  31.46 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1058  methyltransferase, putative  31.46 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.86 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.08 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003929  tRNA (5-methoxyuridine) 34 synthase  25.88 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00210133  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.55 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.47 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0108  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.52 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.29 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>