103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0040 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0040  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  524  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3708  hypothetical protein  36.32 
 
 
241 aa  132  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0409  hypothetical protein  32.02 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8763  hypothetical protein  33.63 
 
 
296 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.613502  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  32.78 
 
 
251 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  32.63 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 
262 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 
253 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  30.34 
 
 
253 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 
253 aa  95.1  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  30.54 
 
 
305 aa  92.8  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  33.76 
 
 
254 aa  92  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  33.76 
 
 
254 aa  92  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  29.31 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  31.56 
 
 
257 aa  88.6  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3894  methyltransferase type 11  29.06 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  28.02 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  27.16 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  28.04 
 
 
248 aa  73.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2578  methyltransferase  29.78 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000179081  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2027  putative methyltransferase  29.21 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2083  putative methyltransferase  27.53 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.018552  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2436  methyltransferase, putative  27.53 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1895  putative methyltransferase  27.53 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.175832 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1950  putative methyltransferase  27.53 
 
 
330 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1932  putative methyltransferase  28.09 
 
 
332 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2187  putative methyltransferase  28.65 
 
 
330 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000631484  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2035  putative methyltransferase  28.09 
 
 
331 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2310  putative methyltransferase  28.09 
 
 
331 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0805655  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2426  putative methyltransferase  28.09 
 
 
331 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487881  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2037  methyltransferase  28.09 
 
 
331 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0212649  hitchhiker  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  28.11 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1890  methyltransferase, putative  28.65 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000006524  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4367  methyltransferase  30.6 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.038567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1440  methyltransferase, putative  30.77 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4281  putative methyltransferase  31.32 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14238  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13850  methyltransferase  29.28 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2082  putative methyltransferase  28.65 
 
 
330 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0434288  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1481  putative methyltransferase  30.73 
 
 
322 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4745  hypothetical protein  27.12 
 
 
322 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1077  methyltransferase  30.73 
 
 
318 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54270  hypothetical protein  26.67 
 
 
322 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1846  methyltransferase, putative  26.97 
 
 
330 aa  63.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.528406  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2369  putative methyltransferase  26.4 
 
 
330 aa  63.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0080  SAM-dependent methyltransferase  25.28 
 
 
324 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00112476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4213  methyltransferase, putative  30.17 
 
 
319 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.987743  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3947  methyltransferase, putative  30.17 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4583  methyltransferase, putative  30.98 
 
 
318 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1884  putative methyltransferase  28.65 
 
 
324 aa  60.1  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2881  methyltransferase  26.67 
 
 
323 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000222337 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0291  putative methyltransferase  26.74 
 
 
353 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2266  methyltransferase  29.05 
 
 
323 aa  58.9  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2094  methyltransferase  28.65 
 
 
327 aa  58.5  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1948  hypothetical protein  28.49 
 
 
350 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1852  methyltransferase, putative  25.7 
 
 
325 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.670085 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0697  putative methyltransferase  27.17 
 
 
328 aa  58.2  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1402  methyltransferase  25.56 
 
 
323 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2790  methyltransferase, putative  27.43 
 
 
324 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383321  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0078  methyltransferase, putative  27.57 
 
 
332 aa  57.4  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0228138  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2241  methyltransferase, putative  28.96 
 
 
363 aa  57.4  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4909  methyltransferase, putative  22.65 
 
 
326 aa  57.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.628924  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003929  tRNA (5-methoxyuridine) 34 synthase  26.4 
 
 
323 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00210133  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1810  methyltransferase  28.09 
 
 
328 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2531  methyltransferase, putative  25.56 
 
 
323 aa  56.6  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149283 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2787  putative methyltransferase  28.09 
 
 
323 aa  55.8  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01594  methyltransferase  25.84 
 
 
323 aa  55.8  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2060  putative methyltransferase  27.36 
 
 
323 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.710945 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1769  methyltransferase  27.53 
 
 
323 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849085  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2548  methyltransferase, putative  26.29 
 
 
333 aa  55.5  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2164  putative methyltransferase  27.53 
 
 
323 aa  55.5  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.96989  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2607  putative methyltransferase  27.53 
 
 
323 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  0.116938 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01842  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.53 
 
 
323 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1965  putative methyltransferase  27.53 
 
 
323 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2102  putative methyltransferase  27.53 
 
 
323 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1761  methyltransferase  27.53 
 
 
323 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1315  putative methyltransferase  27.53 
 
 
323 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01830  hypothetical protein  27.53 
 
 
323 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2065  putative methyltransferase  28.09 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2120  putative methyltransferase  28.09 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000230478 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1217  putative methyltransferase  28.09 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1341  putative methyltransferase  28.09 
 
 
323 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  hitchhiker  0.00030781 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2763  putative methyltransferase  29.14 
 
 
330 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.516525  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0732  hypothetical protein  25.84 
 
 
323 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000183098  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2394  methyltransferase  23.33 
 
 
342 aa  53.9  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4026  putative methyltransferase  26.52 
 
 
323 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2670  methyltransferase  25.41 
 
 
323 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2169  methyltransferase  25.84 
 
 
323 aa  53.1  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2439  putative methyltransferase  27.53 
 
 
323 aa  52.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0272  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  23.03 
 
 
321 aa  52.4  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2430  hypothetical protein  26.4 
 
 
323 aa  52  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.116007 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2152  methyltransferase  26.4 
 
 
323 aa  52  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2111  putative methyltransferase  27.78 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02157  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase domain  25 
 
 
332 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675721  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2039  putative methyltransferase  25.84 
 
 
323 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0420  hypothetical protein  37.74 
 
 
116 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00650863  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0848  Generic methyltransferase  26.4 
 
 
296 aa  43.5  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0015  hypothetical protein  24.37 
 
 
250 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0203643  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0811  hypothetical protein  22.53 
 
 
285 aa  43.1  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>