48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0015 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0015  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  521  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0203643  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11549  hypothetical protein  37.45 
 
 
298 aa  198  7e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1428  methyltransferase type 12  25.35 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678135  hitchhiker  0.000594475 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3263  hypothetical protein  32.76 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  27.27 
 
 
255 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0194  hypothetical protein  24.3 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.604489  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  25.34 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  26.88 
 
 
262 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1261  Methyltransferase type 12  24.89 
 
 
254 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00506996 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  26.32 
 
 
257 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1278  putative methyltransferase  31.85 
 
 
275 aa  48.9  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.337373  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0409  hypothetical protein  23.59 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 
251 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.9 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.16 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.9 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  25.93 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  32.98 
 
 
406 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  26.17 
 
 
229 aa  46.2  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  25 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0898  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33 
 
 
260 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000544337  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0839  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34 
 
 
238 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.761497  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  24.41 
 
 
251 aa  45.4  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
304 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0040  hypothetical protein  24.37 
 
 
249 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.87 
 
 
245 aa  43.9  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12968  hypothetical protein  28.93 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0628  methyltransferase type 11  25 
 
 
268 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0178  methyltransferase type 11  34.57 
 
 
265 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2697  methyltransferase type 12  26.78 
 
 
248 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0566  methyltransferase, putative  24.26 
 
 
291 aa  43.1  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 
258 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  30.1 
 
 
406 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3267  methyltransferase type 11  27.03 
 
 
305 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33 
 
 
243 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.75356  hitchhiker  0.00870455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  22.54 
 
 
277 aa  42.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001055  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  23.76 
 
 
214 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.829142  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3998  hypothetical protein  22.17 
 
 
251 aa  42  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37561  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3894  methyltransferase type 11  28.89 
 
 
257 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  25.85 
 
 
247 aa  42.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.11 
 
 
276 aa  42  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  31.18 
 
 
251 aa  42  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.84 
 
 
239 aa  42  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  28.3 
 
 
287 aa  42  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>