More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0078 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0078  methyltransferase, putative  100 
 
 
332 aa  690    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0228138  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1895  putative methyltransferase  54.49 
 
 
330 aa  364  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.175832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2083  putative methyltransferase  54.49 
 
 
330 aa  364  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.018552  normal  0.426363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1950  putative methyltransferase  54.49 
 
 
330 aa  364  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.590321  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2436  methyltransferase, putative  54.32 
 
 
330 aa  363  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2187  putative methyltransferase  54.32 
 
 
330 aa  360  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000631484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2037  methyltransferase  53.56 
 
 
331 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0212649  hitchhiker  0.0000106333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2426  putative methyltransferase  53.56 
 
 
331 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487881  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2310  putative methyltransferase  53.56 
 
 
331 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0805655  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1932  putative methyltransferase  53.56 
 
 
332 aa  358  6e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2035  putative methyltransferase  53.56 
 
 
331 aa  358  6e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2082  putative methyltransferase  53.56 
 
 
330 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0434288  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1852  methyltransferase, putative  52.45 
 
 
325 aa  355  5e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.670085 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2369  putative methyltransferase  52.63 
 
 
330 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0122535  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1846  methyltransferase, putative  53.25 
 
 
330 aa  353  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.528406  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2578  methyltransferase  52.32 
 
 
330 aa  352  5e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000179081  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1890  methyltransferase, putative  53.25 
 
 
330 aa  348  5e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000006524  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003929  tRNA (5-methoxyuridine) 34 synthase  53.37 
 
 
323 aa  347  2e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00210133  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2027  putative methyltransferase  51.39 
 
 
330 aa  346  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0258345  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01594  methyltransferase  52.76 
 
 
323 aa  345  6e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2763  putative methyltransferase  50.46 
 
 
330 aa  345  6e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.516525  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2169  methyltransferase  52.16 
 
 
323 aa  345  8.999999999999999e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2111  putative methyltransferase  50.31 
 
 
322 aa  343  2.9999999999999997e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2787  putative methyltransferase  52.16 
 
 
323 aa  342  5.999999999999999e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.136015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13850  methyltransferase  53.46 
 
 
319 aa  338  8e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2266  methyltransferase  50.92 
 
 
323 aa  338  8e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2439  putative methyltransferase  51.85 
 
 
323 aa  337  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2094  methyltransferase  50.93 
 
 
327 aa  334  1e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0697  putative methyltransferase  49.85 
 
 
328 aa  333  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2152  methyltransferase  51.23 
 
 
323 aa  332  7.000000000000001e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2430  hypothetical protein  51.23 
 
 
323 aa  331  1e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.116007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1217  putative methyltransferase  51.23 
 
 
323 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4367  methyltransferase  52.37 
 
 
318 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.038567 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1341  putative methyltransferase  51.23 
 
 
323 aa  329  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.321568  hitchhiker  0.00030781 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2120  putative methyltransferase  51.23 
 
 
323 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000230478 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2065  putative methyltransferase  51.23 
 
 
323 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181149 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2039  putative methyltransferase  50.93 
 
 
323 aa  329  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0732  hypothetical protein  50.63 
 
 
323 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000183098  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2060  putative methyltransferase  50.93 
 
 
323 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.710945 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01842  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  49.69 
 
 
323 aa  325  5e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1761  methyltransferase  49.69 
 
 
323 aa  325  5e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2164  putative methyltransferase  49.69 
 
 
323 aa  325  5e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.96989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01830  hypothetical protein  49.69 
 
 
323 aa  325  5e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1965  putative methyltransferase  49.69 
 
 
323 aa  325  5e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1315  putative methyltransferase  49.69 
 
 
323 aa  325  5e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1769  methyltransferase  49.69 
 
 
323 aa  325  6e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0849085  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4213  methyltransferase, putative  51.57 
 
 
319 aa  325  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.987743  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2102  putative methyltransferase  49.69 
 
 
323 aa  325  6e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4026  putative methyltransferase  49.07 
 
 
323 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02157  putative methyltransferase with S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase domain  49.24 
 
 
332 aa  324  1e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0675721  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2607  putative methyltransferase  49.38 
 
 
323 aa  324  1e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.912253  normal  0.116938 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1810  methyltransferase  50.93 
 
 
328 aa  324  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1481  putative methyltransferase  52.56 
 
 
322 aa  324  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.036883  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1948  hypothetical protein  55.52 
 
 
350 aa  323  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4281  putative methyltransferase  51.1 
 
 
318 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14238  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1440  methyltransferase, putative  51.1 
 
 
318 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2548  methyltransferase, putative  50.32 
 
 
333 aa  323  4e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1884  putative methyltransferase  51.12 
 
 
324 aa  322  5e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54270  hypothetical protein  52.43 
 
 
322 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3947  methyltransferase, putative  50.63 
 
 
319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1077  methyltransferase  50.47 
 
 
318 aa  320  3e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2241  methyltransferase, putative  48.98 
 
 
363 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.285029 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0272  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  47.53 
 
 
321 aa  316  4e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4745  hypothetical protein  50.16 
 
 
322 aa  315  8e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.211632  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0291  putative methyltransferase  49.38 
 
 
353 aa  315  9e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1402  methyltransferase  45.85 
 
 
323 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.183467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4583  methyltransferase, putative  49.84 
 
 
318 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2881  methyltransferase  45.68 
 
 
323 aa  311  6.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000222337 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2531  methyltransferase, putative  45.68 
 
 
323 aa  309  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149283 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2670  methyltransferase  45.09 
 
 
323 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2790  methyltransferase, putative  47.59 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.383321  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2394  methyltransferase  49.83 
 
 
342 aa  302  5.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0080  SAM-dependent methyltransferase  44.9 
 
 
324 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00112476  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4909  methyltransferase, putative  39.72 
 
 
326 aa  222  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.628924  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0121  hypothetical protein  41.57 
 
 
298 aa  211  1e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0811  hypothetical protein  37.5 
 
 
285 aa  198  7.999999999999999e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956918  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1345  methyltransferase putative  37.32 
 
 
300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2062  hypothetical protein  39.68 
 
 
289 aa  195  7e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.100668  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0995  methyltransferase, putative  37.86 
 
 
291 aa  196  7e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0848  Generic methyltransferase  40.82 
 
 
296 aa  195  8.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1058  methyltransferase, putative  37.14 
 
 
291 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0814  methyltransferase, putative  37.86 
 
 
291 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.638021  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1075  hypothetical protein  38.55 
 
 
282 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.148018  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0566  methyltransferase, putative  34.93 
 
 
291 aa  186  6e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  28.25 
 
 
253 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 
253 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  30.99 
 
 
255 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
253 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  28.66 
 
 
251 aa  57.4  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0040  hypothetical protein  27.57 
 
 
249 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 
253 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.93 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0187  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 
262 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.408893  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0501  methyltransferase type 12  35.29 
 
 
254 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0241  methyltransferase type 11  32.81 
 
 
262 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1312  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
257 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.728077  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.75 
 
 
247 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.04 
 
 
232 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 
254 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 
252 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>