More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2109 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2109  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  529  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2134  hypothetical protein  98.42 
 
 
253 aa  523  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  36.14 
 
 
266 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  36.14 
 
 
266 aa  176  4e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  28.69 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  28.69 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.69 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
263 aa  75.5  0.0000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  25 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.08 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.36 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  26.97 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.99 
 
 
252 aa  67  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
264 aa  67  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.68 
 
 
255 aa  67  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  26.03 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.77 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.97 
 
 
287 aa  65.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.17 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  22.18 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.17 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  22.18 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.92 
 
 
255 aa  62.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.37 
 
 
261 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  26.71 
 
 
255 aa  62.4  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  23.7 
 
 
256 aa  62.4  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
262 aa  62  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.33 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.7 
 
 
261 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.7 
 
 
221 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  26 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.33 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  28.35 
 
 
256 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
254 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.74 
 
 
269 aa  58.9  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  29.93 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4185  biotin synthesis protein BioC, putative  29.93 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.53 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.43 
 
 
257 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  23.98 
 
 
257 aa  57  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  28.32 
 
 
307 aa  57  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  37.35 
 
 
258 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.95 
 
 
256 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.57 
 
 
262 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3156  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.17 
 
 
258 aa  55.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.63 
 
 
252 aa  55.5  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  32.26 
 
 
269 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0629  methyltransferase type 11  26.77 
 
 
207 aa  55.5  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  30.71 
 
 
285 aa  55.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  26.29 
 
 
268 aa  54.7  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4139  putative biotin synthesis protein BioC  29.2 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  28.78 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4024  biotin synthesis protein BioC  29.2 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3857  biotin synthesis protein  29.2 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3871  biotin synthesis protein  29.2 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4574  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.03 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4337  biotin synthesis protein BioC  29.2 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  30.77 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0533  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
281 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  25.12 
 
 
258 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  24.88 
 
 
337 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.91 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.97 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  24.7 
 
 
279 aa  53.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.68 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  24.62 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  45.71 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
344 aa  53.5  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  29.31 
 
 
283 aa  53.9  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.19 
 
 
259 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2550  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
348 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00904798  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3947  biotin biosynthesis protein BioC  27.01 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  27.01 
 
 
312 aa  53.1  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
280 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.03 
 
 
260 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.83 
 
 
258 aa  52.8  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  26.92 
 
 
275 aa  52  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.25 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  28.1 
 
 
273 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.03 
 
 
256 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.69 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.85 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.85 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  25.35 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.85 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2241  methyltransferase type 11  26.21 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  30.4 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.9 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2668  hypothetical protein  27.21 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>