63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0069 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0069  LmbE family protein  100 
 
 		 217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0637  putative deacetylase  58.04 
 
 		 225 aa  256  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0368  LmbE family protein  52.2 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.758546  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0783  LmbE family protein  39.71 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.227533 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1043  LmbE family protein  39.52 
 
 		 208 aa  144  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.22333 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0440  hypothetical protein  43 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.584207  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3392  LmbE family protein  42.79 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0383  hypothetical protein  42.51 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3950  LmbE-like protein  39.71 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.591961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1041  hypothetical protein  36.32 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.574529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0835  LmbE family protein  27.23 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.335446  normal  0.172446 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1918  hypothetical protein  27.59 
 
 		 302 aa  67  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19030  uncharacterized LmbE-like protein  29.65 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.248574  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0426  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.6 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0386  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.6 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3264  LmbE family protein  27.6 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0392  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  27.6 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.138175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0277  putative GlcNAc-PI de-N-acetylase  26.13 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4697  LmbE family protein  29.49 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1460  LmbE family protein  25.44 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0532009  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2122  LmbE family protein  34.64 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.674571  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1590  hypothetical protein  24.57 
 
 		 234 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1417  hypothetical protein  25.88 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.490751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3755  hypothetical protein  24.57 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1701  hypothetical protein  25.44 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00454663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1628  hypothetical protein  25.44 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.148873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1663  hypothetical protein  25.44 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1416  hypothetical protein  25.44 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.812012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1557  hypothetical protein  25.44 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1444  hypothetical protein  25.44 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140604  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0239  LmbE family protein  26.47 
 
 		 207 aa  51.6  0.000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.817384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2324  LmbE family protein  31.62 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1800  LmbE-like protein  24.84 
 
 		 286 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.14671 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22640  response regulator with CheY-like receiver, AAA-type ATPase, and DNA-binding domains  33.14 
 
 		 358 aa  49.3  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.800771 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_193  LmbE  28.3 
 
 		 265 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.599254  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1249  LmbE-like protein  29.46 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.975053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1258  LmbE family protein  29.91 
 
 		 234 aa  48.5  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.274401  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0425  LmbE family protein  23.11 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0619658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1583  LmbE family protein  23.66 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.383068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0585  LmbE family protein  26.94 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000208418  normal  0.164964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1995  LmbE family protein  32.52 
 
 		 276 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0990731 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0168  hypothetical protein  26.64 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2252  hypothetical protein  22.6 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.960737  hitchhiker  0.007979 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  26.62 
 
 		 265 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2305  LmbE-like protein protein  39.25 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3646  LmbE family protein  28.25 
 
 		 221 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.746983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1774  LmbE family protein  33.91 
 
 		 249 aa  45.1  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0211  putative LmbE-like protein  27.95 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0137  LmbE family protein  29.19 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.295286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1269  response regulator receiver protein  29.83 
 
 		 359 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.324523 
 
 
-
 
NC_002936  DET0216  hypothetical protein  26.11 
 
 		 277 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  30.16 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1286  LmbE family protein  30.28 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.636367  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2820  LmbE family protein  28.9 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1596  hypothetical protein  35.04 
 
 		 247 aa  44.3  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0661  putative LmbE-like protein  29 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0532448  normal  0.938153 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1530  LmbE family protein  33.91 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.276807  normal  0.0194959 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3596  LmbE family protein  30 
 
 		 248 aa  42.4  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0902  LmbE family protein  34.21 
 
 		 245 aa  42.4  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  28 
 
 		 502 aa  42  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3433  LmbE-like protein  31.3 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0020  LmbE family protein  34.43 
 
 		 255 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  28.57 
 
 		 471 aa  41.6  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>