28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30247 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_30247  N-acetylglucosaminyl phosphatidylinositol de-N-acetylase  100 
 
 		 312 aa  634    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0132801  normal  0.189227 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00049  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol deacetylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12550)  32.35 
 
 		 312 aa  142  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0143318  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00580  N-acetylglucosaminylphosphatidylinositol deacetylase, putative  29.88 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34610  n-acetylglucosaminyl phosphatidylinositol deacetylase  25.64 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.135228  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34729  predicted protein  25.82 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2948  LmbE family protein  33.11 
 
 		 299 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48208  hitchhiker  0.00495516 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2816  LmbE family protein  27.88 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0595539 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3864  LmbE-like protein  22.75 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0961679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3789  LmbE family protein  28.66 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.728369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2672  LmbE family protein  23.83 
 
 		 246 aa  53.5  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0453  LmbE family protein  23.81 
 
 		 238 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0634  LmbE family protein  27.15 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2667  LmbE family protein  25.85 
 
 		 272 aa  49.7  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0865  LmbE family protein  24.61 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.76321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0954  LmbE family protein  23.63 
 
 		 231 aa  48.5  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.52879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3036  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- gluc opyranosidedeacetylase  23.84 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3218  LmbE family protein  28.67 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10328  hypothetical protein  23.91 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0756  1D-myo-inosityl-2-acetamido-2-deoxy-alpha-D- glucopyranoside deacetylase  24.53 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4145  LmbE family protein  21.74 
 
 		 308 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0240973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0630  LmbE family protein  29.73 
 
 		 240 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3459  LmbE-like protein  24.05 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0368  LmbE-like protein protein  22.45 
 
 		 218 aa  43.1  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8449  conserved hypothetical protein LmbE  23.03 
 
 		 302 aa  43.1  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1432  LmbE family protein  34.21 
 
 		 275 aa  42.7  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192895  normal  0.886775 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2430  LmbE family protein  23.95 
 
 		 274 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3024  LmbE family protein  27.22 
 
 		 288 aa  42.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.439999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1285  LmbE family protein  23.49 
 
 		 217 aa  42.4  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>