29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5643 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5643  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184267  normal  0.153331 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6391  LmbE family protein  94.89 
 
 		 235 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.126432 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5449  LmbE family protein  77.02 
 
 		 231 aa  331  6e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070373 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1376  hypothetical protein  76.17 
 
 		 231 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.418228  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6453  LmbE family protein  76.17 
 
 		 231 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6045  LmbE family protein  74.04 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.048617  normal  0.182794 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1380  hypothetical protein  62.98 
 
 		 230 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3161  hypothetical protein  62.55 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3032  hypothetical protein  62.13 
 
 		 230 aa  248  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359721  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1980  hypothetical protein  62.13 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2266  hypothetical protein  62.13 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.948048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1291  hypothetical protein  62.13 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.602531  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1002  hypothetical protein  62.13 
 
 		 230 aa  248  8e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4392  hypothetical protein  44.12 
 
 		 245 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.45148  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4725  LmbE family protein  40.77 
 
 		 238 aa  148  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0749271 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2231  hypothetical protein  36.8 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5995  LmbE family protein  37.83 
 
 		 234 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.220645 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3813  LmbE family protein  39.64 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4890  LmbE family protein  39.64 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0748012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2182  hypothetical protein  36.77 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1416  LmbE family protein  29.6 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.993291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3974  LmbE family protein  28.82 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222206 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3052  LmbE family protein  28.21 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237793 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  34.74 
 
 		 260 aa  48.5  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3591  LmbE family protein  44.83 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.00215841 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3570  LmbE-like protein  25.48 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.839683  decreased coverage  0.00474608 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1018  LmbE family protein  32 
 
 		 240 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  28.47 
 
 		 193 aa  42  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2686  LmbE family protein  31.6 
 
 		 253 aa  42  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>