27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5449 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5449  LmbE family protein  100 
 
 
231 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070373 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6391  LmbE family protein  77.92 
 
 
235 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.126432 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5643  hypothetical protein  77.02 
 
 
235 aa  349  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184267  normal  0.153331 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1376  hypothetical protein  76.19 
 
 
231 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.418228  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6453  LmbE family protein  76.19 
 
 
231 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6045  LmbE family protein  75.76 
 
 
231 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.048617  normal  0.182794 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3161  hypothetical protein  63.2 
 
 
230 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1380  hypothetical protein  63.2 
 
 
230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1980  hypothetical protein  62.77 
 
 
230 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2266  hypothetical protein  62.77 
 
 
230 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.948048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1291  hypothetical protein  62.77 
 
 
230 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.602531  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1002  hypothetical protein  62.77 
 
 
230 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3032  hypothetical protein  62.34 
 
 
230 aa  249  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359721  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4392  hypothetical protein  43.83 
 
 
245 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.45148  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4725  LmbE family protein  41.74 
 
 
238 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0749271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3813  LmbE family protein  42.66 
 
 
240 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4890  LmbE family protein  42.66 
 
 
240 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0748012 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2231  hypothetical protein  37.89 
 
 
235 aa  136  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5995  LmbE family protein  38.5 
 
 
234 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.220645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2182  hypothetical protein  39.35 
 
 
233 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3974  LmbE family protein  30.77 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.222206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1416  LmbE family protein  31.36 
 
 
272 aa  61.6  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.993291  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3052  LmbE family protein  29.52 
 
 
269 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237793 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  25.32 
 
 
260 aa  45.4  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3591  LmbE family protein  42.53 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.00215841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1018  LmbE family protein  38.14 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0697  LmbE family protein  24.39 
 
 
193 aa  43.5  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>