23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4392 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4392  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  501  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.45148  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6391  LmbE family protein  42.68 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.126432 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5643  hypothetical protein  42.68 
 
 		 235 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184267  normal  0.153331 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5449  LmbE family protein  43.83 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070373 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2231  hypothetical protein  39.51 
 
 		 235 aa  149  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3032  hypothetical protein  41.67 
 
 		 230 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359721  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2266  hypothetical protein  41.67 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.948048  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1980  hypothetical protein  41.67 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1291  hypothetical protein  41.67 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.602531  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1002  hypothetical protein  41.67 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1380  hypothetical protein  41.67 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3161  hypothetical protein  41.67 
 
 		 230 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4890  LmbE family protein  39.3 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0748012 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3813  LmbE family protein  39.3 
 
 		 240 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5995  LmbE family protein  38.02 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.220645 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4725  LmbE family protein  39.51 
 
 		 238 aa  141  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0749271 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6453  LmbE family protein  42.74 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1376  hypothetical protein  42.74 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.418228  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6045  LmbE family protein  42.74 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.048617  normal  0.182794 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3052  LmbE family protein  31.51 
 
 		 269 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3974  LmbE family protein  30.51 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.222206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2182  hypothetical protein  34.78 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1416  LmbE family protein  29.44 
 
 		 272 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.993291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>