27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A1380 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A1380  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3161  hypothetical protein  99.57 
 
 
230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1002  hypothetical protein  99.13 
 
 
230 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1291  hypothetical protein  99.13 
 
 
230 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.602531  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2266  hypothetical protein  99.13 
 
 
230 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.948048  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1980  hypothetical protein  99.13 
 
 
230 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3032  hypothetical protein  98.7 
 
 
230 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359721  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5643  hypothetical protein  62.98 
 
 
235 aa  265  5e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184267  normal  0.153331 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5449  LmbE family protein  63.2 
 
 
231 aa  264  8e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070373 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6391  LmbE family protein  61.28 
 
 
235 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.126432 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1376  hypothetical protein  60.17 
 
 
231 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.418228  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6453  LmbE family protein  60.17 
 
 
231 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6045  LmbE family protein  59.74 
 
 
231 aa  211  9e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.048617  normal  0.182794 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4392  hypothetical protein  41.67 
 
 
245 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.45148  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4725  LmbE family protein  40.09 
 
 
238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0749271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3813  LmbE family protein  41.47 
 
 
240 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4890  LmbE family protein  41.47 
 
 
240 aa  139  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0748012 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5995  LmbE family protein  37.84 
 
 
234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.220645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2231  hypothetical protein  37.17 
 
 
235 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2182  hypothetical protein  36.73 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3052  LmbE family protein  30.89 
 
 
269 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3974  LmbE family protein  33.18 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.222206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1416  LmbE family protein  30.04 
 
 
272 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.993291  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1018  LmbE family protein  32.53 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0204  chemotaxis protein CheA  27.65 
 
 
758 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3114  LmbE family protein  25.59 
 
 
260 aa  45.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3591  LmbE family protein  42.35 
 
 
252 aa  43.9  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.00215841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>