28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6045 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6045  LmbE family protein  100 
 
 
231 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.048617  normal  0.182794 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1376  hypothetical protein  92.21 
 
 
231 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.418228  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6453  LmbE family protein  92.21 
 
 
231 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5643  hypothetical protein  74.04 
 
 
235 aa  329  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184267  normal  0.153331 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6391  LmbE family protein  72.77 
 
 
235 aa  328  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.429883  normal  0.126432 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5449  LmbE family protein  75.76 
 
 
231 aa  314  6e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070373 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1380  hypothetical protein  59.74 
 
 
230 aa  222  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.147089  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3161  hypothetical protein  59.74 
 
 
230 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1002  hypothetical protein  59.74 
 
 
230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1291  hypothetical protein  59.74 
 
 
230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.602531  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2266  hypothetical protein  59.74 
 
 
230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.948048  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1980  hypothetical protein  59.74 
 
 
230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3032  hypothetical protein  59.31 
 
 
230 aa  217  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359721  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4392  hypothetical protein  42.74 
 
 
245 aa  166  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.45148  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4725  LmbE family protein  41.59 
 
 
238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0749271 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4890  LmbE family protein  39.45 
 
 
240 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0748012 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3813  LmbE family protein  39.45 
 
 
240 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2231  hypothetical protein  39.71 
 
 
235 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5995  LmbE family protein  40.89 
 
 
234 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.220645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1416  LmbE family protein  32.74 
 
 
272 aa  79  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.993291  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3052  LmbE family protein  29.74 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3974  LmbE family protein  31.53 
 
 
263 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.222206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2182  hypothetical protein  37.42 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1018  LmbE family protein  34.34 
 
 
240 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3591  LmbE family protein  33.33 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  hitchhiker  0.00215841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0082  LmbE family protein  27.2 
 
 
250 aa  45.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2686  LmbE family protein  30.49 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218362  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2808  LmbE family protein  30.04 
 
 
253 aa  42  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>