More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1973 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1973  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 
1137 aa  2296    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.337773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2448  MCP methyltransferase, CheR-type  36.46 
 
 
1140 aa  561  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0720096  normal  0.188853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3408  amino acid adenylation domain protein  36.28 
 
 
3207 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2053  amino acid adenylation  49.32 
 
 
1070 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0492406  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  44.17 
 
 
6072 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  44.17 
 
 
6081 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0023  linear gramicidin synthetase subunit B  40.1 
 
 
2681 aa  412  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  44.17 
 
 
3352 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  46.26 
 
 
7122 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  44.17 
 
 
3328 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  44.17 
 
 
6006 aa  410  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  47.94 
 
 
5738 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  42.32 
 
 
4882 aa  392  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  48.08 
 
 
9175 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  47.8 
 
 
5929 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  43.54 
 
 
1069 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  46.52 
 
 
2370 aa  373  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  47.28 
 
 
5372 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  47.61 
 
 
6676 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  46.91 
 
 
1142 aa  373  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  48.68 
 
 
5926 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  44.25 
 
 
1093 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  38.61 
 
 
1336 aa  366  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  41.04 
 
 
1334 aa  364  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  46.84 
 
 
1689 aa  362  3e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  46.1 
 
 
2561 aa  360  6e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1934  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  36.84 
 
 
1280 aa  359  1.9999999999999998e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  40.04 
 
 
888 aa  358  2.9999999999999997e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6556  siderophore 2,3-dihydroxybenzoate (DHB) synthesis protein  42.71 
 
 
1305 aa  358  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416947  hitchhiker  0.00000457979 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  41.32 
 
 
13537 aa  357  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  48.64 
 
 
3710 aa  355  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  40.31 
 
 
4531 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  39.06 
 
 
1317 aa  355  2.9999999999999997e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  46.06 
 
 
5596 aa  355  2.9999999999999997e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  44.6 
 
 
1449 aa  354  4e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  46.94 
 
 
8646 aa  354  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  46.33 
 
 
9498 aa  354  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  45.47 
 
 
5422 aa  353  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  41.78 
 
 
1315 aa  352  3e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  43.32 
 
 
627 aa  351  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  42.78 
 
 
6403 aa  349  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  38.09 
 
 
4968 aa  349  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  44.83 
 
 
5469 aa  348  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  35.42 
 
 
1336 aa  344  5.999999999999999e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  40.35 
 
 
2875 aa  344  7e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  43.56 
 
 
5953 aa  342  2e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  43.21 
 
 
7168 aa  342  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.37 
 
 
2385 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  35.28 
 
 
2385 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.28 
 
 
2385 aa  337  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  46.61 
 
 
3639 aa  337  7.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.37 
 
 
2385 aa  337  9e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.43 
 
 
2385 aa  337  9e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.43 
 
 
2385 aa  337  9e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  36.54 
 
 
2386 aa  337  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.59 
 
 
2385 aa  336  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2272  enterobactin synthase subunit F  38.48 
 
 
1296 aa  335  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0155539  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  35.12 
 
 
2385 aa  335  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1248  amino acid adenylation domain protein  42.95 
 
 
653 aa  335  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  40.14 
 
 
8211 aa  335  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  37.89 
 
 
2883 aa  335  4e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.74 
 
 
2385 aa  334  5e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  39.21 
 
 
1383 aa  332  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  44.85 
 
 
3247 aa  332  3e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  34.26 
 
 
1439 aa  331  5.0000000000000004e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  34.91 
 
 
2386 aa  331  6e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  38.99 
 
 
1405 aa  330  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  43.72 
 
 
6889 aa  330  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  39.13 
 
 
2883 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  38.96 
 
 
1870 aa  329  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  44.39 
 
 
4572 aa  328  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0855  amino acid adenylation domain protein  38.59 
 
 
1375 aa  328  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  40.62 
 
 
2156 aa  327  6e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  41.31 
 
 
2164 aa  326  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  39.38 
 
 
1870 aa  326  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  38.31 
 
 
2448 aa  327  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  39.5 
 
 
1078 aa  326  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  41.36 
 
 
2156 aa  326  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  46.15 
 
 
3018 aa  326  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  41.31 
 
 
3235 aa  325  4e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3369  amino acid adenylation  45.68 
 
 
2315 aa  323  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.878862  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2570  amino acid adenylation domain-containing protein  40.09 
 
 
3114 aa  323  9.000000000000001e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0117255 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  41.06 
 
 
2387 aa  323  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  40.94 
 
 
2156 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  40.79 
 
 
1454 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  32.26 
 
 
1345 aa  322  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1746  amino acid adenylation domain protein  43.58 
 
 
3223 aa  321  5e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  44.32 
 
 
2626 aa  321  5e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  43.01 
 
 
4991 aa  321  5e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  42.61 
 
 
4468 aa  321  6e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4495  amino acid adenylation domain protein  44.65 
 
 
559 aa  320  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  41.87 
 
 
4502 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  36.9 
 
 
3101 aa  320  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  42.89 
 
 
2187 aa  319  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  43.62 
 
 
5213 aa  318  4e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  41.89 
 
 
1518 aa  318  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  38.17 
 
 
3348 aa  317  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  44.65 
 
 
4383 aa  317  7e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  38.2 
 
 
1568 aa  317  8e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  37.99 
 
 
2508 aa  317  9e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>