More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1680 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  43.02 
 
 		 3470 aa  761    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  42.83 
 
 		 4317 aa  718    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  41.2 
 
 		 2174 aa  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  42.83 
 
 		 4317 aa  696    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  41.71 
 
 		 8646 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  40.62 
 
 		 5953 aa  700    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  44.35 
 
 		 6889 aa  748    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.88 
 
 		 2385 aa  832    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  41.18 
 
 		 4336 aa  689    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  44.02 
 
 		 1137 aa  788    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  45.67 
 
 		 2625 aa  837    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  51.94 
 
 		 2151 aa  995    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  36.15 
 
 		 2875 aa  715    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  45.58 
 
 		 5929 aa  800    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  48.17 
 
 		 6176 aa  867    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.51 
 
 		 3432 aa  659    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  39.77 
 
 		 4531 aa  738    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.24 
 
 		 2385 aa  832    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  39.6 
 
 		 2385 aa  825    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  39.02 
 
 		 2385 aa  826    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  43.61 
 
 		 8914 aa  774    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  35.65 
 
 		 2156 aa  696    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  36.96 
 
 		 1518 aa  698    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  37.73 
 
 		 1127 aa  637    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  45.11 
 
 		 3639 aa  811    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  40.8 
 
 		 4336 aa  699    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.65 
 
 		 2385 aa  826    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  47.25 
 
 		 2666 aa  828    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  52.13 
 
 		 2154 aa  1013    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  36.36 
 
 		 2883 aa  717    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  46.73 
 
 		 5926 aa  839    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  42.82 
 
 		 9498 aa  773    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  39.46 
 
 		 5372 aa  638    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  40.18 
 
 		 5469 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  39.11 
 
 		 13537 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  40.23 
 
 		 6676 aa  749    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  45.73 
 
 		 2867 aa  867    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  35.66 
 
 		 1363 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  38.42 
 
 		 1142 aa  677    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  38.77 
 
 		 3308 aa  684    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  38.99 
 
 		 3498 aa  696    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.8 
 
 		 2385 aa  842    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  38.48 
 
 		 2033 aa  674    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  48.45 
 
 		 3331 aa  852    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  41.92 
 
 		 2820 aa  656    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  39.33 
 
 		 2386 aa  823    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  34.69 
 
 		 1436 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  39.29 
 
 		 2386 aa  835    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  43.42 
 
 		 4468 aa  788    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  39.5 
 
 		 2155 aa  647    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  43.41 
 
 		 6072 aa  799    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  43.7 
 
 		 4572 aa  792    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  38.85 
 
 		 3291 aa  653    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  41.67 
 
 		 5654 aa  712    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  41.23 
 
 		 4502 aa  798    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  54.8 
 
 		 1383 aa  1439    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  42.61 
 
 		 4882 aa  688    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  49.77 
 
 		 3942 aa  1009    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  35.95 
 
 		 1369 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  40.6 
 
 		 4332 aa  702    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  40.31 
 
 		 2370 aa  709    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  39.24 
 
 		 2385 aa  832    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  39.91 
 
 		 4037 aa  680    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  38.99 
 
 		 1138 aa  679    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  49.36 
 
 		 2137 aa  909    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  41.66 
 
 		 4383 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  36.94 
 
 		 5596 aa  647    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0845  amino acid adenylation domain-containing protein  37.98 
 
 		 1119 aa  647    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0731661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  39.69 
 
 		 4489 aa  709    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  44.37 
 
 		 6081 aa  815    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  43.06 
 
 		 4317 aa  706    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  52.11 
 
 		 4991 aa  991    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  42.5 
 
 		 3432 aa  751    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  34.2 
 
 		 1331 aa  639    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  36.02 
 
 		 3395 aa  678    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  36.41 
 
 		 1816 aa  679    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  37.81 
 
 		 6661 aa  706    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  42.55 
 
 		 4342 aa  690    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  41.71 
 
 		 5149 aa  718    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  41.18 
 
 		 2189 aa  746    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  46.97 
 
 		 2448 aa  1083    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  40.8 
 
 		 5328 aa  646    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 		 1405 aa  2842    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2091  amino acid adenylation domain-containing protein  41.74 
 
 		 1145 aa  718    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  64.95 
 
 		 5230 aa  1216    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  40.71 
 
 		 2651 aa  645    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  40.75 
 
 		 1789 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  40.83 
 
 		 1129 aa  678    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  42.22 
 
 		 4968 aa  858    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  42.73 
 
 		 1569 aa  835    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  36.44 
 
 		 1518 aa  692    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  35.83 
 
 		 2156 aa  704    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  42.28 
 
 		 4342 aa  683    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  42.52 
 
 		 1114 aa  742    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  40.82 
 
 		 3404 aa  661    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  42.56 
 
 		 4317 aa  711    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  41.37 
 
 		 2845 aa  692    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  36.73 
 
 		 3291 aa  706    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  41.8 
 
 		 4136 aa  712    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  38.85 
 
 		 3348 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>