More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0855 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0855  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
1375 aa  2774    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  35.34 
 
 
1142 aa  618  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  33.25 
 
 
3291 aa  603  1.0000000000000001e-171  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  35.35 
 
 
7712 aa  597  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  37.93 
 
 
5596 aa  593  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  37.63 
 
 
1689 aa  587  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  34.63 
 
 
3308 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  34.86 
 
 
2033 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  34.82 
 
 
2561 aa  578  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  34.2 
 
 
3432 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  35.21 
 
 
6072 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  37.07 
 
 
2370 aa  573  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  35.12 
 
 
6006 aa  573  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  37.35 
 
 
3639 aa  568  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  35.12 
 
 
3328 aa  569  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  33.49 
 
 
2193 aa  568  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  34.15 
 
 
6661 aa  568  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  35.12 
 
 
3352 aa  569  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  34.96 
 
 
6081 aa  569  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  35.94 
 
 
6676 aa  566  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  32.84 
 
 
3235 aa  565  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  35.53 
 
 
3824 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  31.64 
 
 
3086 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  36.28 
 
 
3018 aa  561  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  35.53 
 
 
2664 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  32.45 
 
 
1363 aa  558  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  31.64 
 
 
3086 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  32.56 
 
 
1093 aa  559  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4838  amino acid adenylation  30.21 
 
 
1436 aa  556  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0776089 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  31.89 
 
 
1556 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  31.98 
 
 
1556 aa  558  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  33.12 
 
 
3498 aa  556  1e-156  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  33.21 
 
 
5738 aa  550  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.45 
 
 
4531 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  31.1 
 
 
2385 aa  551  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  34.16 
 
 
2571 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  34.16 
 
 
2571 aa  551  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  30.85 
 
 
2386 aa  551  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3129  amino acid adenylation domain-containing protein  32.23 
 
 
1816 aa  551  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.975665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.35 
 
 
2385 aa  548  1e-154  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  30.83 
 
 
2385 aa  546  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  35.5 
 
 
2419 aa  546  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.39 
 
 
2385 aa  546  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  32.65 
 
 
2867 aa  544  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.91 
 
 
2385 aa  546  1e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.39 
 
 
2385 aa  546  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  34.46 
 
 
6403 aa  545  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.46 
 
 
2385 aa  545  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  34.25 
 
 
1578 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.81 
 
 
2385 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.17 
 
 
2385 aa  539  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  32.29 
 
 
13537 aa  539  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  35.53 
 
 
4318 aa  538  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  34.88 
 
 
4317 aa  539  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  32.66 
 
 
7122 aa  538  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  33.18 
 
 
4960 aa  535  1e-150  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  32.6 
 
 
2006 aa  533  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  31.27 
 
 
1833 aa  533  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  32.39 
 
 
1550 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  32.34 
 
 
2164 aa  531  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  33.27 
 
 
4968 aa  532  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.48 
 
 
8646 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  30.04 
 
 
1336 aa  530  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2413  amino acid adenylation domain-containing protein  33.02 
 
 
1569 aa  529  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  34.29 
 
 
4336 aa  530  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  32.99 
 
 
8211 aa  529  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  31.9 
 
 
2156 aa  530  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  34.48 
 
 
4342 aa  529  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  32.31 
 
 
1069 aa  529  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  33.24 
 
 
3942 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.5 
 
 
6889 aa  526  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  33.64 
 
 
1839 aa  525  1e-147  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  32.68 
 
 
2791 aa  524  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  31.29 
 
 
2156 aa  525  1e-147  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  35.18 
 
 
3002 aa  526  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  31.76 
 
 
1369 aa  525  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  33.61 
 
 
3453 aa  524  1e-147  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  31.44 
 
 
2156 aa  526  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  30.51 
 
 
2386 aa  524  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  34.87 
 
 
2189 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  35.19 
 
 
4747 aa  525  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  34.26 
 
 
4336 aa  522  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  33.93 
 
 
2151 aa  522  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  33.67 
 
 
4332 aa  520  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  30.83 
 
 
2581 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  34.64 
 
 
4342 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  34.95 
 
 
9498 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  33.33 
 
 
4317 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  32.61 
 
 
4960 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  33.3 
 
 
4317 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  33.49 
 
 
4317 aa  512  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  34.31 
 
 
5953 aa  512  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  36.44 
 
 
4383 aa  511  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  34.05 
 
 
5926 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  33.79 
 
 
4991 aa  512  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  28.86 
 
 
1331 aa  512  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  34.84 
 
 
1137 aa  512  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  34.64 
 
 
1769 aa  509  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  34.97 
 
 
3021 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  33.11 
 
 
4502 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>