More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4495 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4495  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
559 aa  1075    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  43.61 
 
 
1093 aa  466  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  42.15 
 
 
1069 aa  462  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  41.09 
 
 
627 aa  459  9.999999999999999e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  49.4 
 
 
3639 aa  439  9.999999999999999e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  48.8 
 
 
3018 aa  430  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  39 
 
 
1449 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  43.64 
 
 
2561 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4895  amino acid adenylation domain-containing protein  49.66 
 
 
1035 aa  414  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  50.35 
 
 
1726 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  36.1 
 
 
1078 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  39.19 
 
 
1142 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  40.79 
 
 
1689 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  41.58 
 
 
5596 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1248  amino acid adenylation domain protein  44.59 
 
 
653 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  39.75 
 
 
5738 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  38.98 
 
 
7122 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  48.32 
 
 
8211 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  42.28 
 
 
6676 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  42.31 
 
 
2370 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  42.38 
 
 
8646 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2725  amino acid adenylation domain-containing protein  43.25 
 
 
588 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0175538  normal  0.742433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6968  non-ribosomal peptide synthetase  44.29 
 
 
599 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5582  putative nonribosomal peptide synthetase (NPRS)  44.66 
 
 
1654 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344509  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2948  amino acid adenylation domain-containing protein  41.3 
 
 
1057 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.735724  normal  0.0141341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  37.7 
 
 
9175 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  41.25 
 
 
5372 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  43.58 
 
 
6081 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  43.75 
 
 
6072 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  43.75 
 
 
6006 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  43.5 
 
 
3328 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  43.5 
 
 
3352 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  39.5 
 
 
3308 aa  363  4e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  43.01 
 
 
1769 aa  362  7.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2053  amino acid adenylation  41.36 
 
 
1070 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0492406  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  41.09 
 
 
4336 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  41.99 
 
 
4882 aa  361  2e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  43.77 
 
 
3710 aa  361  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  42.61 
 
 
5422 aa  359  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0855  amino acid adenylation domain protein  39.82 
 
 
1375 aa  359  8e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  40.86 
 
 
5953 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3762  amino acid adenylation domain protein  40.48 
 
 
637 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  44.3 
 
 
3247 aa  356  5.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  40.52 
 
 
5469 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6051  amino acid adenylation domain-containing protein  45.05 
 
 
500 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0828298  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  40.31 
 
 
4383 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  35.31 
 
 
1336 aa  352  8e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  40.1 
 
 
4336 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  41.86 
 
 
13537 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  39.53 
 
 
4332 aa  350  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  40.2 
 
 
9498 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  39.89 
 
 
5929 aa  347  4e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6556  siderophore 2,3-dihydroxybenzoate (DHB) synthesis protein  43.4 
 
 
1305 aa  346  5e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416947  hitchhiker  0.00000457979 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5821  amino acid adenylation domain-containing protein  42.71 
 
 
506 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565457  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  42.88 
 
 
5750 aa  344  2e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  37.06 
 
 
2386 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.06 
 
 
2385 aa  344  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  42.61 
 
 
2352 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  39.42 
 
 
2033 aa  343  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  37.12 
 
 
2385 aa  343  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  36.29 
 
 
1870 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  40.97 
 
 
6889 aa  342  8e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.76 
 
 
2385 aa  342  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  40.82 
 
 
4342 aa  342  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  43.32 
 
 
2454 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.35 
 
 
2385 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  40.82 
 
 
4342 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  37.27 
 
 
2385 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  35.95 
 
 
1870 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  42.5 
 
 
2614 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.89 
 
 
2385 aa  340  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.89 
 
 
2385 aa  340  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  41.84 
 
 
1498 aa  339  7e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1558  amino acid adenylation domain-containing protein  42.81 
 
 
3227 aa  339  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  36.44 
 
 
1518 aa  339  8e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  32.72 
 
 
1439 aa  339  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4309  amino acid adenylation domain protein  42.83 
 
 
2577 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.867052 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0023  linear gramicidin synthetase subunit B  35.73 
 
 
2681 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  37.19 
 
 
2386 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1934  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  34.74 
 
 
1280 aa  338  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  38.98 
 
 
3168 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  41.18 
 
 
1315 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  38.62 
 
 
4531 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  42.04 
 
 
4318 aa  337  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3369  amino acid adenylation  42.16 
 
 
2315 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.878862  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.52 
 
 
2385 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  40.35 
 
 
3335 aa  337  5e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.69 
 
 
2385 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1615  amino acid adenylation domain-containing protein  42.65 
 
 
3221 aa  336  7e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0566356 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  37.31 
 
 
1753 aa  335  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  38.2 
 
 
1578 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  42.73 
 
 
3231 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  42.73 
 
 
3231 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  41.16 
 
 
5926 aa  335  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  42 
 
 
7310 aa  333  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  42.28 
 
 
3227 aa  334  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3845  amino acid adenylation domain-containing protein  40.35 
 
 
1721 aa  334  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549835  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  36.1 
 
 
1518 aa  333  5e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  34.47 
 
 
2193 aa  332  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  41.74 
 
 
3219 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>