More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5821 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5821  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 		 506 aa  1018    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6051  amino acid adenylation domain-containing protein  95.45 
 
 		 500 aa  950    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0828298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1226  peptide synthetase, putative  59.52 
 
 		 548 aa  567  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1659  linear gramicidin synthetase subunit C  59.24 
 
 		 505 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1578  linear gramicidin synthetase subunit C  59.24 
 
 		 505 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0146  nonribosomal peptide synthetase  59.05 
 
 		 505 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  40.7 
 
 		 1093 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  38.89 
 
 		 1069 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1248  amino acid adenylation domain protein  44.84 
 
 		 653 aa  358  9e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3762  amino acid adenylation domain protein  41.8 
 
 		 637 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  39.53 
 
 		 627 aa  350  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  39.69 
 
 		 1449 aa  350  4e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  41.54 
 
 		 1689 aa  349  8e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  41.76 
 
 		 5596 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4495  amino acid adenylation domain protein  43.71 
 
 		 559 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  43.17 
 
 		 3018 aa  342  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  41.27 
 
 		 2561 aa  333  3e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  40.9 
 
 		 3824 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  40.67 
 
 		 2664 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  42.04 
 
 		 3639 aa  327  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  35.28 
 
 		 1078 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  38.69 
 
 		 7122 aa  322  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0023  linear gramicidin synthetase subunit B  37.45 
 
 		 2681 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4895  amino acid adenylation domain-containing protein  41.9 
 
 		 1035 aa  313  4.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_003296  RS03120  putative peptide synthetase protein  42.62 
 
 		 1418 aa  311  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  37.04 
 
 		 1142 aa  312  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  40.55 
 
 		 5953 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  39.33 
 
 		 3335 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2121  linear gramicidin synthetase subunit C  40.08 
 
 		 528 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.847277  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  40.52 
 
 		 5929 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2579  amino acid adenylation domain-containing protein  39.22 
 
 		 649 aa  306  7e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.947565  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0855  amino acid adenylation domain protein  40.85 
 
 		 1375 aa  306  7e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  35.62 
 
 		 2385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3369  amino acid adenylation  39.6 
 
 		 2315 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.878862  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  36.02 
 
 		 2385 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  41.72 
 
 		 1726 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.83 
 
 		 2385 aa  299  8e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  36.26 
 
 		 9175 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.33 
 
 		 2385 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  36.45 
 
 		 2387 aa  298  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  37.23 
 
 		 5738 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  38.67 
 
 		 5372 aa  296  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.63 
 
 		 2385 aa  296  8e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.63 
 
 		 2385 aa  296  8e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  39.14 
 
 		 4882 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.4 
 
 		 2385 aa  294  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.81 
 
 		 2385 aa  293  4e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.31 
 
 		 2385 aa  292  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  37.65 
 
 		 5469 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  38.04 
 
 		 5422 aa  289  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6968  non-ribosomal peptide synthetase  38.31 
 
 		 599 aa  289  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  41.25 
 
 		 5926 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  34.77 
 
 		 2386 aa  286  7e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  38.26 
 
 		 6072 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  38.4 
 
 		 3352 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  38.6 
 
 		 6006 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  38.4 
 
 		 3328 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  38.4 
 
 		 6081 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  37.52 
 
 		 6676 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  38.26 
 
 		 13537 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0169  thioester reductase domain-containing protein  35.25 
 
 		 2391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0164  thioester reductase domain-containing protein  35.25 
 
 		 2391 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  40.36 
 
 		 8211 aa  283  5.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1934  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  33.27 
 
 		 1280 aa  283  5.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  37.3 
 
 		 2370 aa  281  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  37.09 
 
 		 8646 aa  277  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4309  amino acid adenylation domain protein  39.41 
 
 		 2577 aa  276  5e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  37.74 
 
 		 7168 aa  276  6e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  38.7 
 
 		 3710 aa  276  7e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1704  amino acid adenylation  38.04 
 
 		 1322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.410435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  39.6 
 
 		 3247 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2948  amino acid adenylation domain-containing protein  37.08 
 
 		 1057 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.735724  normal  0.0141341 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4035  amino acid adenylation domain-containing protein  36.28 
 
 		 521 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1973  MCP methyltransferase, CheR-type  43.51 
 
 		 1137 aa  274  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337773 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2053  amino acid adenylation  36.76 
 
 		 1070 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0492406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3487  amino acid adenylation domain-containing protein  38 
 
 		 521 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2570  amino acid adenylation domain-containing protein  35.2 
 
 		 3114 aa  273  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48530  putative AMP-binding enzyme  36.79 
 
 		 618 aa  269  7e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.741053  normal  0.0209642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  38.3 
 
 		 2454 aa  269  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  35.12 
 
 		 2386 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5582  putative nonribosomal peptide synthetase (NPRS)  36.4 
 
 		 1654 aa  266  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344509  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  35.56 
 
 		 4336 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  33.59 
 
 		 1439 aa  263  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  35.29 
 
 		 6176 aa  263  6.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  37.3 
 
 		 3629 aa  262  8e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1746  amino acid adenylation domain protein  35.45 
 
 		 3223 aa  262  8.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  37.28 
 
 		 1334 aa  262  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  36.74 
 
 		 6889 aa  261  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  37.14 
 
 		 1789 aa  259  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  30.83 
 
 		 2791 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  34.45 
 
 		 888 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  39.1 
 
 		 7310 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  33.85 
 
 		 2867 aa  257  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  33.2 
 
 		 2156 aa  257  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2267  amino acid adenylation  35.41 
 
 		 3031 aa  257  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.962511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  37.74 
 
 		 4572 aa  256  5e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  33.79 
 
 		 2156 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  38.1 
 
 		 2125 aa  256  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  37.38 
 
 		 1315 aa  256  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  33.2 
 
 		 2156 aa  256  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>