More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A1578 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007435  BURPS1710b_A0146  nonribosomal peptide synthetase  99.6 
 
 
505 aa  1001    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1226  peptide synthetase, putative  90.56 
 
 
548 aa  905    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1659  linear gramicidin synthetase subunit C  99.41 
 
 
505 aa  1001    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1578  linear gramicidin synthetase subunit C  100 
 
 
505 aa  1006    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6051  amino acid adenylation domain-containing protein  60.16 
 
 
500 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0828298  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5821  amino acid adenylation domain-containing protein  59.24 
 
 
506 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565457  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  43.55 
 
 
5596 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  43.55 
 
 
1689 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  40.93 
 
 
627 aa  380  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  41.15 
 
 
1093 aa  377  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  39.2 
 
 
1069 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3762  amino acid adenylation domain protein  42.77 
 
 
637 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  40.36 
 
 
1449 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1248  amino acid adenylation domain protein  41.88 
 
 
653 aa  347  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  40.56 
 
 
6676 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  41.13 
 
 
2561 aa  341  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  41.57 
 
 
3018 aa  331  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  40.36 
 
 
5929 aa  329  6e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  42.52 
 
 
3639 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4495  amino acid adenylation domain protein  44.16 
 
 
559 aa  327  3e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0855  amino acid adenylation domain protein  42.34 
 
 
1375 aa  325  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  36.58 
 
 
1142 aa  323  5e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  41.14 
 
 
3710 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  41.63 
 
 
13537 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  39.39 
 
 
7122 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  40.54 
 
 
5953 aa  319  9e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  38.37 
 
 
9175 aa  319  9e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  43.66 
 
 
1726 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  42.18 
 
 
5926 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  40.99 
 
 
8646 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  40.24 
 
 
2370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  40.89 
 
 
3335 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  37.88 
 
 
3824 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4895  amino acid adenylation domain-containing protein  42.74 
 
 
1035 aa  312  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  37.88 
 
 
2664 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2579  amino acid adenylation domain-containing protein  41.14 
 
 
649 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.947565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  38.74 
 
 
5738 aa  309  8e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0023  linear gramicidin synthetase subunit B  36.76 
 
 
2681 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  34.7 
 
 
1078 aa  307  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  38.49 
 
 
5372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  39.33 
 
 
9498 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  38.49 
 
 
5422 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03120  putative peptide synthetase protein  41.24 
 
 
1418 aa  297  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2121  linear gramicidin synthetase subunit C  37.7 
 
 
528 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.847277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  39.05 
 
 
4882 aa  296  8e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  36.91 
 
 
5469 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  39.64 
 
 
3328 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  39.64 
 
 
3352 aa  294  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  39.88 
 
 
6006 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  39.88 
 
 
6072 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  39.88 
 
 
6081 aa  293  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  35.69 
 
 
2387 aa  292  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6968  non-ribosomal peptide synthetase  39.16 
 
 
599 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3487  amino acid adenylation domain-containing protein  38.54 
 
 
521 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4035  amino acid adenylation domain-containing protein  38.46 
 
 
521 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1746  amino acid adenylation domain protein  38.61 
 
 
3223 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1934  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  34.5 
 
 
1280 aa  286  5e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2948  amino acid adenylation domain-containing protein  37.77 
 
 
1057 aa  286  5.999999999999999e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.735724  normal  0.0141341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  36.65 
 
 
3165 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  38.63 
 
 
6176 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  39.44 
 
 
8211 aa  285  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  38.16 
 
 
4037 aa  283  6.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0164  thioester reductase domain-containing protein  35.47 
 
 
2391 aa  282  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0169  thioester reductase domain-containing protein  35.47 
 
 
2391 aa  282  9e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  38.65 
 
 
4383 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.52 
 
 
2385 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.28 
 
 
2385 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  34.13 
 
 
2385 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.06 
 
 
2385 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  39.88 
 
 
1789 aa  280  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  34.9 
 
 
888 aa  280  6e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  37.22 
 
 
7168 aa  280  6e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3369  amino acid adenylation  38.54 
 
 
2315 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.878862  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  34.77 
 
 
2386 aa  276  9e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.93 
 
 
4531 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2725  amino acid adenylation domain-containing protein  36.73 
 
 
588 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0175538  normal  0.742433 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1177  amino acid adenylation  34.93 
 
 
3137 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  33.4 
 
 
2385 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1973  MCP methyltransferase, CheR-type  46.84 
 
 
1137 aa  274  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.337773 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  38.55 
 
 
1315 aa  274  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  35.52 
 
 
3168 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.86 
 
 
2385 aa  274  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  39.64 
 
 
2454 aa  273  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1970  amino acid adenylation domain-containing protein  38.13 
 
 
1137 aa  273  5.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0949143 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  38.39 
 
 
4991 aa  273  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.26 
 
 
2385 aa  272  9e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  33.46 
 
 
2156 aa  272  9e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  33.47 
 
 
2386 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2053  amino acid adenylation  36.01 
 
 
1070 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0492406  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.66 
 
 
2385 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.66 
 
 
2385 aa  270  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  37.96 
 
 
1334 aa  270  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  36.47 
 
 
6889 aa  270  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  37.42 
 
 
2605 aa  270  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  37.84 
 
 
2651 aa  269  8e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  34.58 
 
 
2867 aa  269  8.999999999999999e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5582  putative nonribosomal peptide synthetase (NPRS)  36.52 
 
 
1654 aa  269  8.999999999999999e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344509  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  38.25 
 
 
3247 aa  269  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  38.1 
 
 
4572 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  34.9 
 
 
4968 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>