More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3762 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3762  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 		 637 aa  1276    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  44.37 
 
 		 3335 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2579  amino acid adenylation domain-containing protein  41.2 
 
 		 649 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.947565  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  39.9 
 
 		 627 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  38.67 
 
 		 1449 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  39.08 
 
 		 1093 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1248  amino acid adenylation domain protein  43.85 
 
 		 653 aa  411  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  40.03 
 
 		 1069 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0855  amino acid adenylation domain protein  43.44 
 
 		 1375 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  40.54 
 
 		 3639 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  39.5 
 
 		 5596 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  38.98 
 
 		 1689 aa  364  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  37.59 
 
 		 1142 aa  364  3e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0146  nonribosomal peptide synthetase  41.98 
 
 		 505 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1659  linear gramicidin synthetase subunit C  41.98 
 
 		 505 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1578  linear gramicidin synthetase subunit C  41.98 
 
 		 505 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6051  amino acid adenylation domain-containing protein  42.77 
 
 		 500 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0828298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4495  amino acid adenylation domain protein  40.48 
 
 		 559 aa  357  5e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  39.44 
 
 		 5372 aa  355  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  42.7 
 
 		 2664 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  42.47 
 
 		 3824 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1226  peptide synthetase, putative  41.15 
 
 		 548 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  38.05 
 
 		 6676 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  39.83 
 
 		 13537 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  35.76 
 
 		 2561 aa  344  4e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  37.56 
 
 		 2370 aa  343  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5821  amino acid adenylation domain-containing protein  41.43 
 
 		 506 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  39.49 
 
 		 3018 aa  342  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  38.42 
 
 		 5469 aa  339  8e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_003296  RS03120  putative peptide synthetase protein  39.16 
 
 		 1418 aa  338  1.9999999999999998e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  38.04 
 
 		 8646 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  34.63 
 
 		 1078 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  38.06 
 
 		 1726 aa  327  6e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  36.88 
 
 		 5738 aa  325  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2053  amino acid adenylation  36.32 
 
 		 1070 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0492406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1177  amino acid adenylation  35.23 
 
 		 3137 aa  323  5e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  36.82 
 
 		 4882 aa  323  6e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  37.04 
 
 		 5929 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  37.01 
 
 		 5422 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4895  amino acid adenylation domain-containing protein  36.54 
 
 		 1035 aa  320  5e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  33.95 
 
 		 7122 aa  319  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  39.04 
 
 		 2454 aa  317  3e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  36.43 
 
 		 2387 aa  316  9e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  36.87 
 
 		 5953 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5582  putative nonribosomal peptide synthetase (NPRS)  36.07 
 
 		 1654 aa  311  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0023  linear gramicidin synthetase subunit B  37.1 
 
 		 2681 aa  311  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  33.39 
 
 		 2385 aa  309  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  35.2 
 
 		 9175 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.07 
 
 		 2385 aa  306  6e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2948  amino acid adenylation domain-containing protein  35.79 
 
 		 1057 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.735724  normal  0.0141341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.91 
 
 		 2385 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.91 
 
 		 2385 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  37.24 
 
 		 5926 aa  303  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  37.26 
 
 		 9498 aa  301  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  33.5 
 
 		 1454 aa  300  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  34.51 
 
 		 7168 aa  299  9e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.33 
 
 		 2385 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1934  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  31.57 
 
 		 1280 aa  298  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  32.38 
 
 		 2385 aa  297  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  36.59 
 
 		 8211 aa  297  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0169  thioester reductase domain-containing protein  35.85 
 
 		 2391 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  33.84 
 
 		 2581 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0164  thioester reductase domain-containing protein  35.85 
 
 		 2391 aa  295  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.5 
 
 		 2385 aa  295  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1704  amino acid adenylation  35.98 
 
 		 1322 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.410435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6968  non-ribosomal peptide synthetase  35.63 
 
 		 599 aa  294  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  36.09 
 
 		 1315 aa  294  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.22 
 
 		 2385 aa  293  6e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  32.61 
 
 		 1336 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  34.25 
 
 		 2164 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3092  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 		 1533 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3090  amino acid adenylation domain protein  32.83 
 
 		 1466 aa  289  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2725  amino acid adenylation domain-containing protein  33.16 
 
 		 588 aa  289  8e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0175538  normal  0.742433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  32.85 
 
 		 3308 aa  289  9e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3031  amino acid adenylation domain protein  32.66 
 
 		 1466 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  35.07 
 
 		 2791 aa  289  1e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  36.2 
 
 		 3650 aa  288  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  35.19 
 
 		 3247 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2570  amino acid adenylation domain-containing protein  33.11 
 
 		 3114 aa  288  2.9999999999999996e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  34.69 
 
 		 2596 aa  287  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  33.61 
 
 		 1786 aa  287  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  31.84 
 
 		 2386 aa  287  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  32.74 
 
 		 2386 aa  287  4e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  34.38 
 
 		 1518 aa  287  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  35.45 
 
 		 3328 aa  287  5e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  32.47 
 
 		 3235 aa  287  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  34.67 
 
 		 3710 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  35.45 
 
 		 3352 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2968  amino acid adenylation domain-containing protein  32.9 
 
 		 1331 aa  286  7e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2121  linear gramicidin synthetase subunit C  37.22 
 
 		 528 aa  286  8e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.847277  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  35.38 
 
 		 6081 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3029  amino acid adenylation domain protein  32.79 
 
 		 1533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.04 
 
 		 6889 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  35.22 
 
 		 6072 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4309  amino acid adenylation domain protein  34.51 
 
 		 2577 aa  284  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867052 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  33.56 
 
 		 1776 aa  284  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4035  amino acid adenylation domain-containing protein  36.73 
 
 		 521 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  35.28 
 
 		 6006 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  33.5 
 
 		 2316 aa  283  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  34.47 
 
 		 4882 aa  283  9e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>