More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4035 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4035  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
521 aa  1057    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3487  amino acid adenylation domain-containing protein  98.66 
 
 
521 aa  1045    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2121  linear gramicidin synthetase subunit C  59.2 
 
 
528 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.847277  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  39.57 
 
 
1142 aa  351  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  39.28 
 
 
627 aa  344  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  41.52 
 
 
2664 aa  344  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  41.3 
 
 
3824 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  41.78 
 
 
8646 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  38.49 
 
 
1069 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  37.79 
 
 
1093 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  41.39 
 
 
2370 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  36.65 
 
 
1078 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  37.38 
 
 
1449 aa  319  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  36.8 
 
 
2387 aa  318  1e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  38.77 
 
 
13537 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  42.5 
 
 
3710 aa  311  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  38.21 
 
 
7122 aa  311  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  39.88 
 
 
6072 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  39.69 
 
 
3328 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  39.69 
 
 
3352 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  39.69 
 
 
6081 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  39.88 
 
 
6006 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  41.89 
 
 
3639 aa  304  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  39.38 
 
 
2561 aa  305  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  40.43 
 
 
1334 aa  302  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  37.72 
 
 
5929 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0023  linear gramicidin synthetase subunit B  34.71 
 
 
2681 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  37.81 
 
 
6676 aa  301  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  37.45 
 
 
1689 aa  300  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  37.45 
 
 
5596 aa  300  6e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5582  putative nonribosomal peptide synthetase (NPRS)  40.36 
 
 
1654 aa  298  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344509  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  41.14 
 
 
1315 aa  297  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4895  amino acid adenylation domain-containing protein  40.36 
 
 
1035 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2948  amino acid adenylation domain-containing protein  36.56 
 
 
1057 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.735724  normal  0.0141341 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2725  amino acid adenylation domain-containing protein  38.79 
 
 
588 aa  293  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0175538  normal  0.742433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  38.75 
 
 
4882 aa  293  8e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  36.67 
 
 
9175 aa  292  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2579  amino acid adenylation domain-containing protein  37.7 
 
 
649 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.947565  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6968  non-ribosomal peptide synthetase  39.24 
 
 
599 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0855  amino acid adenylation domain protein  40.04 
 
 
1375 aa  289  9e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  40.47 
 
 
2454 aa  289  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1226  peptide synthetase, putative  37.9 
 
 
548 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1704  amino acid adenylation  39 
 
 
1322 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.410435 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  37.92 
 
 
5926 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  39.72 
 
 
3018 aa  287  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3762  amino acid adenylation domain protein  36.2 
 
 
637 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6556  siderophore 2,3-dihydroxybenzoate (DHB) synthesis protein  40.2 
 
 
1305 aa  287  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416947  hitchhiker  0.00000457979 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  35.32 
 
 
4968 aa  286  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  35.2 
 
 
3235 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  34.82 
 
 
5738 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  38.43 
 
 
5422 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20780  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  38.73 
 
 
3539 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.040794 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  39.84 
 
 
1726 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  38.78 
 
 
4383 aa  283  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  35.31 
 
 
7168 aa  283  7.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  34.99 
 
 
4960 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  35.7 
 
 
5469 aa  283  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  36.35 
 
 
5372 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  37.64 
 
 
5953 aa  280  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  34.76 
 
 
4960 aa  279  8e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  40.04 
 
 
3247 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  35.66 
 
 
1454 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  33.92 
 
 
2791 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1659  linear gramicidin synthetase subunit C  37.9 
 
 
505 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1578  linear gramicidin synthetase subunit C  37.9 
 
 
505 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.02 
 
 
2385 aa  276  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0146  nonribosomal peptide synthetase  37.7 
 
 
505 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  34.49 
 
 
3432 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  35.38 
 
 
2606 aa  274  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  39.84 
 
 
2605 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1248  amino acid adenylation domain protein  37.37 
 
 
653 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  34.49 
 
 
1556 aa  273  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  34.3 
 
 
1556 aa  273  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  32.31 
 
 
4196 aa  273  8.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  37.3 
 
 
6889 aa  272  9e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  34.68 
 
 
2385 aa  272  1e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.01 
 
 
2385 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2053  amino acid adenylation  37.55 
 
 
1070 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0492406  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.6 
 
 
2385 aa  272  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  34.75 
 
 
2385 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  37.25 
 
 
9498 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.75 
 
 
2385 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2570  amino acid adenylation domain-containing protein  32.16 
 
 
3114 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0117255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  35.41 
 
 
1127 aa  271  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  35.35 
 
 
2033 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  35.89 
 
 
1714 aa  271  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6051  amino acid adenylation domain-containing protein  37.25 
 
 
500 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0828298  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  33.74 
 
 
2386 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  36.61 
 
 
4531 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  34.39 
 
 
2508 aa  270  5e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  34.08 
 
 
1550 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.34 
 
 
2385 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  36.13 
 
 
1336 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  38.91 
 
 
6999 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5821  amino acid adenylation domain-containing protein  35.93 
 
 
506 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565457  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  35.37 
 
 
4502 aa  269  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  35.01 
 
 
5213 aa  268  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1673  thiotemplate mechanism natural product synthetase  37.96 
 
 
3925 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3090  amino acid adenylation domain protein  33.53 
 
 
1466 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3369  amino acid adenylation  38.62 
 
 
2315 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.878862  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>