More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2121 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2121  linear gramicidin synthetase subunit C  100 
 
 
528 aa  1067    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.847277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3487  amino acid adenylation domain-containing protein  59.39 
 
 
521 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.350151 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4035  amino acid adenylation domain-containing protein  59.2 
 
 
521 aa  593  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  39.41 
 
 
1069 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  39.48 
 
 
627 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  40.12 
 
 
1142 aa  364  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  41.67 
 
 
2664 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  41.45 
 
 
3824 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  37.28 
 
 
1078 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  37.55 
 
 
1449 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  37.15 
 
 
1093 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  40.78 
 
 
7122 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  43.16 
 
 
3710 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  41.83 
 
 
2370 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  41.43 
 
 
8646 aa  333  4e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  40.08 
 
 
5929 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  38.52 
 
 
6676 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0023  linear gramicidin synthetase subunit B  36.8 
 
 
2681 aa  320  5e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  41.97 
 
 
1315 aa  320  5e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  40.79 
 
 
5926 aa  319  7e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5582  putative nonribosomal peptide synthetase (NPRS)  41.73 
 
 
1654 aa  315  9e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344509  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  37.91 
 
 
2387 aa  314  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  40.75 
 
 
3639 aa  308  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  37.01 
 
 
5596 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  37.01 
 
 
1689 aa  308  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  39.8 
 
 
4882 aa  306  6e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4895  amino acid adenylation domain-containing protein  41.25 
 
 
1035 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  39.69 
 
 
2561 aa  305  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1226  peptide synthetase, putative  37.62 
 
 
548 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6051  amino acid adenylation domain-containing protein  39.24 
 
 
500 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0828298  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5821  amino acid adenylation domain-containing protein  39.29 
 
 
506 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565457  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  36.01 
 
 
5738 aa  303  5.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  38.77 
 
 
4383 aa  302  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  41.2 
 
 
1726 aa  302  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  36.65 
 
 
5469 aa  300  3e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  33.79 
 
 
4196 aa  300  4e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  35.89 
 
 
2385 aa  300  5e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.71 
 
 
2385 aa  300  5e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  37.3 
 
 
2385 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  39.8 
 
 
5422 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.33 
 
 
2385 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  39.61 
 
 
3018 aa  297  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6556  siderophore 2,3-dihydroxybenzoate (DHB) synthesis protein  40.33 
 
 
1305 aa  296  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416947  hitchhiker  0.00000457979 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  35.02 
 
 
2867 aa  296  7e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  36.83 
 
 
5372 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  36.31 
 
 
9175 aa  295  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1659  linear gramicidin synthetase subunit C  37.47 
 
 
505 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1704  amino acid adenylation  40.76 
 
 
1322 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.410435 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1578  linear gramicidin synthetase subunit C  37.5 
 
 
505 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.08 
 
 
2385 aa  292  8e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.08 
 
 
2385 aa  292  8e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  38.31 
 
 
9498 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0146  nonribosomal peptide synthetase  37.3 
 
 
505 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.119564  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  39.43 
 
 
2605 aa  291  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  35.92 
 
 
1454 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  36.33 
 
 
2385 aa  290  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  38.58 
 
 
13537 aa  289  7e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3762  amino acid adenylation domain protein  37.13 
 
 
637 aa  289  9e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.5 
 
 
2385 aa  289  1e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  35.16 
 
 
2385 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2948  amino acid adenylation domain-containing protein  36.19 
 
 
1057 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.735724  normal  0.0141341 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  34.65 
 
 
1556 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  38.54 
 
 
5953 aa  286  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  34.75 
 
 
4968 aa  286  7e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03120  putative peptide synthetase protein  39.44 
 
 
1418 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  34.37 
 
 
1518 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  35.52 
 
 
3235 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2725  amino acid adenylation domain-containing protein  37.01 
 
 
588 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0175538  normal  0.742433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  37.52 
 
 
1990 aa  284  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  38.48 
 
 
4290 aa  284  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  38.93 
 
 
7310 aa  283  6.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  34.44 
 
 
1518 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  39.15 
 
 
8211 aa  283  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6968  non-ribosomal peptide synthetase  37.37 
 
 
599 aa  282  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1934  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  34.69 
 
 
1280 aa  282  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3369  amino acid adenylation  39.53 
 
 
2315 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.878862  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  34.46 
 
 
1556 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  38.11 
 
 
8915 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  35.7 
 
 
2386 aa  281  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  38.11 
 
 
8914 aa  280  3e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1746  amino acid adenylation domain protein  37.3 
 
 
3223 aa  280  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4495  amino acid adenylation domain protein  39.51 
 
 
559 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2461  amino acid adenylation  39.57 
 
 
4606 aa  279  8e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.782467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  38.9 
 
 
3629 aa  279  9e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  33.98 
 
 
4960 aa  279  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  36.72 
 
 
1334 aa  279  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2384  amino acid adenylation domain protein  35.92 
 
 
2508 aa  278  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  38.79 
 
 
3328 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  33.14 
 
 
2791 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  34.05 
 
 
1518 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  37.68 
 
 
3168 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  34.72 
 
 
2386 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  38.99 
 
 
6072 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  38.39 
 
 
4572 aa  277  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  38.79 
 
 
3352 aa  277  4e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  38.99 
 
 
6006 aa  277  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  38.79 
 
 
6081 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1879  amino acid adenylation domain-containing protein  37.01 
 
 
2419 aa  276  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  40.38 
 
 
2454 aa  276  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2568  amino acid adenylation domain-containing protein  35.62 
 
 
1083 aa  276  9e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.403624  hitchhiker  0.0000320919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>