More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2461 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_07884  nonribosomal peptide synthase, putative (JCVI)  25.52 
 
 
7214 aa  696    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.729291  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1615  amino acid adenylation domain-containing protein  33.92 
 
 
3221 aa  928    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0566356 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1927  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  32.74 
 
 
3290 aa  898    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  34.59 
 
 
2845 aa  1118    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  32.99 
 
 
2628 aa  1048    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  31.56 
 
 
6404 aa  1168    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  34.35 
 
 
4317 aa  1104    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  30.87 
 
 
6661 aa  884    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  35.33 
 
 
3018 aa  1142    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  29.14 
 
 
2006 aa  844    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4072  amino acid adenylation domain protein  32.46 
 
 
3230 aa  982    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753138 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  34.21 
 
 
4336 aa  1155    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  33.53 
 
 
2625 aa  1142    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  36.01 
 
 
5230 aa  1901    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  35.16 
 
 
2875 aa  1221    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2092  amino acid adenylation domain-containing protein  32.52 
 
 
1661 aa  783    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  33.31 
 
 
3208 aa  871    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  35.84 
 
 
5467 aa  1928    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3029  amino acid adenylation domain protein  30.72 
 
 
1533 aa  665    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1877  amino acid adenylation domain-containing protein  33 
 
 
1525 aa  658    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  35.79 
 
 
2606 aa  1191    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  28.9 
 
 
3374 aa  813    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1715  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  25.59 
 
 
2543 aa  928    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1716  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  26.67 
 
 
3044 aa  1021    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1717  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  28.67 
 
 
2295 aa  894    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  31.66 
 
 
1556 aa  756    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  34.98 
 
 
1990 aa  1055    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  32.44 
 
 
4960 aa  1248    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  35 
 
 
5328 aa  1245    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  34.1 
 
 
4336 aa  1145    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  33.12 
 
 
2666 aa  1075    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1858  amino acid adenylation domain-containing protein  32.4 
 
 
1528 aa  638    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  35.23 
 
 
2883 aa  1216    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  33.86 
 
 
3432 aa  1261    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1558  amino acid adenylation domain-containing protein  33.27 
 
 
3227 aa  910    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  35.99 
 
 
4342 aa  1185    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  31.88 
 
 
3224 aa  994    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  37.16 
 
 
4136 aa  2071    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  28.09 
 
 
4080 aa  1215    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  31.9 
 
 
2571 aa  651    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1865  amino acid adenylation  43.22 
 
 
1344 aa  665    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1866  amino acid adenylation  44.47 
 
 
1074 aa  665    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.996538  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  38.31 
 
 
3629 aa  1264    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  33.78 
 
 
3404 aa  1177    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  34.2 
 
 
4317 aa  1088    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  31.96 
 
 
3086 aa  1026    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  32.53 
 
 
4960 aa  1255    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  32.25 
 
 
3498 aa  971    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  33.56 
 
 
2033 aa  1020    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0873  putative non-ribosomal peptide synthetase  32.49 
 
 
3294 aa  894    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  29.75 
 
 
3395 aa  1152    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2569  amino acid adenylation domain-containing protein  33.7 
 
 
2971 aa  890    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188555 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2086  putative siderophore related no-ribosomal peptide synthase  32.74 
 
 
3287 aa  907    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2663  nonribosomal peptide synthetase  32.71 
 
 
2979 aa  935    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  35.42 
 
 
6176 aa  1159    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  37.88 
 
 
2561 aa  764    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  30.78 
 
 
2164 aa  740    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  39.11 
 
 
6999 aa  1347    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2097  amino acid adenylation domain-containing protein  27.14 
 
 
1992 aa  655    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.164393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  35.07 
 
 
5654 aa  2195    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  33.45 
 
 
4502 aa  1231    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  34.35 
 
 
4317 aa  1106    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  31.89 
 
 
2883 aa  1036    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  31.76 
 
 
2156 aa  640    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  34.65 
 
 
3231 aa  1112    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  34.94 
 
 
4332 aa  1172    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  33.33 
 
 
3219 aa  910    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  35.12 
 
 
3942 aa  1299    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  35.58 
 
 
4037 aa  1288    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0288  putative non-ribosomal peptide synthetase  32.49 
 
 
3294 aa  894    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  35.26 
 
 
3962 aa  1184    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1956  non-ribosomal peptide synthetase, putative  31.7 
 
 
2967 aa  951    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  31.86 
 
 
3650 aa  868    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  32.59 
 
 
3296 aa  929    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  50.48 
 
 
4290 aa  1214    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  85.6 
 
 
4489 aa  1562    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  73.46 
 
 
2605 aa  1907    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2461  amino acid adenylation  100 
 
 
4606 aa  8883    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.782467 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  33.41 
 
 
4968 aa  1278    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2522  non-ribosomal peptide synthase  32.71 
 
 
2979 aa  946    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207691  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  32.53 
 
 
3180 aa  971    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  34.26 
 
 
2596 aa  1252    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  34 
 
 
3231 aa  931    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5751  amino acid adenylation domain protein  33.25 
 
 
1578 aa  715    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  33.01 
 
 
3227 aa  910    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  34.37 
 
 
3176 aa  862    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  33.86 
 
 
3018 aa  1211    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  36.03 
 
 
4342 aa  1197    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  34.91 
 
 
5149 aa  1313    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1598  amino acid adenylation domain-containing protein  33.38 
 
 
3219 aa  956    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  35.65 
 
 
3235 aa  1079    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  34 
 
 
3231 aa  931    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  36.76 
 
 
1069 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3844  amino acid adenylation domain-containing protein  37.92 
 
 
1493 aa  723    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0760504  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  37.1 
 
 
2651 aa  1134    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1942  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  32.67 
 
 
3290 aa  899    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  35.43 
 
 
4991 aa  1244    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2575  non-ribosomal peptide synthase  32.52 
 
 
2979 aa  924    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1625  putative non-ribosomal peptide synthetase  32.49 
 
 
3297 aa  894    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0842979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  34.19 
 
 
4317 aa  1115    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>