More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1865 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.35 
 
 
2385 aa  723    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.25 
 
 
2385 aa  714    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6557  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  43.52 
 
 
2320 aa  657    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000475071 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  33.26 
 
 
4968 aa  713    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  41.57 
 
 
5620 aa  704    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.57 
 
 
2385 aa  719    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  33.83 
 
 
2385 aa  722    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.39 
 
 
2385 aa  716    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  51.14 
 
 
4090 aa  796    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  41.2 
 
 
2561 aa  756    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  34.29 
 
 
2385 aa  723    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  44.62 
 
 
2614 aa  768    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  33.04 
 
 
4960 aa  684    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  34.94 
 
 
2386 aa  719    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20780  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  41.43 
 
 
3539 aa  664    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.040794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1865  amino acid adenylation  100 
 
 
1344 aa  2660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1866  amino acid adenylation  44.8 
 
 
1074 aa  685    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.996538  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  42.42 
 
 
3629 aa  674    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1494  amino acid adenylation domain protein  36.13 
 
 
2846 aa  644    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.42 
 
 
2385 aa  715    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  36.42 
 
 
2877 aa  659    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  39.94 
 
 
1315 aa  839    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.57 
 
 
2385 aa  719    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  52.12 
 
 
4449 aa  922    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  41.2 
 
 
2605 aa  641    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2461  amino acid adenylation  43.22 
 
 
4606 aa  652    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.782467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18420  amino acid adenylation enzyme/thioester reductase family protein  44.33 
 
 
2365 aa  724    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  43.9 
 
 
7310 aa  739    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  53.57 
 
 
7541 aa  890    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  32.45 
 
 
4960 aa  680    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  51.17 
 
 
6999 aa  829    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  34.47 
 
 
2385 aa  713    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  42.74 
 
 
4106 aa  655    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  34.54 
 
 
2386 aa  720    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  40.81 
 
 
5750 aa  627  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3733  amino acid adenylation domain protein  35.98 
 
 
2855 aa  628  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0631  amino acid adenylation domain protein  40 
 
 
1529 aa  622  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2719  amino acid adenylation domain protein  40.12 
 
 
3410 aa  603  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  37.45 
 
 
8211 aa  606  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  37.18 
 
 
4489 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  34.56 
 
 
3524 aa  605  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  35.87 
 
 
2878 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  35.22 
 
 
1069 aa  602  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  35.99 
 
 
7785 aa  593  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  34.33 
 
 
2875 aa  592  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  31.72 
 
 
1870 aa  592  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  36.34 
 
 
3761 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  31.48 
 
 
1870 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  35.66 
 
 
4037 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  38.6 
 
 
2626 aa  579  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  34.3 
 
 
1454 aa  583  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  34.62 
 
 
2883 aa  580  1e-164  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1746  amino acid adenylation domain protein  35.2 
 
 
3532 aa  582  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000653127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  36.03 
 
 
3470 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  37.42 
 
 
4136 aa  572  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2697  amino acid adenylation domain-containing protein  38.79 
 
 
1459 aa  568  1e-160  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0193464  normal  0.834924 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  36.76 
 
 
5213 aa  564  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1883  non-ribosomal peptide synthetase  35.59 
 
 
1314 aa  561  1e-158  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.20791  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1617  amino acid adenylation domain-containing protein  31.93 
 
 
1336 aa  561  1e-158  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3844  amino acid adenylation domain-containing protein  38.01 
 
 
1493 aa  560  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0760504  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  38.32 
 
 
2651 aa  561  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3732  amino acid adenylation domain protein  34.32 
 
 
6113 aa  559  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  39.45 
 
 
5467 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  37.96 
 
 
5149 aa  560  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3693  amino acid adenylation domain protein  34.85 
 
 
2274 aa  553  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3342  peptide synthetase  33.79 
 
 
1334 aa  556  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  35.44 
 
 
2845 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  35.28 
 
 
6676 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  36.74 
 
 
3962 aa  553  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  33.12 
 
 
2156 aa  551  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  30.44 
 
 
3291 aa  552  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  38.18 
 
 
3018 aa  548  1e-154  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  33.65 
 
 
4991 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  32.74 
 
 
2156 aa  549  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3465  amino acid adenylation  38.03 
 
 
1461 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.126363  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3528  amino acid adenylation domain-containing protein  38.03 
 
 
1461 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.567451 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12404  peptide synthetase mbtF  37.02 
 
 
1461 aa  548  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  32.88 
 
 
5738 aa  546  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3476  amino acid adenylation domain-containing protein  37.99 
 
 
1460 aa  544  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047214 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  31.33 
 
 
1078 aa  545  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  34.42 
 
 
3942 aa  546  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  32.65 
 
 
2156 aa  546  1e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  35.31 
 
 
5230 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  30.19 
 
 
1317 aa  545  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  31.45 
 
 
3086 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  34.48 
 
 
2883 aa  541  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  36.77 
 
 
2606 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  34.61 
 
 
2571 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  37.19 
 
 
4747 aa  541  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  31.79 
 
 
3086 aa  539  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1741  amino acid adenylation domain protein  39.61 
 
 
2403 aa  538  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  36.85 
 
 
3432 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  36.99 
 
 
7712 aa  538  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  36.32 
 
 
3231 aa  539  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  34.61 
 
 
2571 aa  540  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2569  amino acid adenylation domain-containing protein  34.79 
 
 
2971 aa  536  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.61 
 
 
4531 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  35.35 
 
 
5926 aa  534  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  34.43 
 
 
9498 aa  535  1e-150  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  34.99 
 
 
5654 aa  536  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>