More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5064 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001302  ANIA_07884  nonribosomal peptide synthase, putative (JCVI)  26.07 
 
 
7214 aa  932    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.729291  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02621  N-(5-amino-5-carboxypentanoyl)-L-cysteinyl-D- valine synthase (EC 6.3.2.26)(Delta-(L-alpha-aminoadipyl)-L-cysteinyl-D- valine synthetase)(ACV synthetase)(ACVS) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27742]  29.54 
 
 
3770 aa  1045    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.830211 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02545  nonribosomal peptide synthase, putative (Eurofung)  26.05 
 
 
6919 aa  894    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.668891  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  34.61 
 
 
3470 aa  1336    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  37.42 
 
 
2628 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  34.85 
 
 
2174 aa  981    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  31.54 
 
 
4317 aa  1040    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  30.09 
 
 
2387 aa  751    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  37.49 
 
 
5953 aa  2011    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  36.2 
 
 
6889 aa  1920    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.24 
 
 
2385 aa  1177    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  31.86 
 
 
4336 aa  1082    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  35.13 
 
 
2151 aa  998    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  35.89 
 
 
5328 aa  1533    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  32.64 
 
 
3168 aa  1150    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  35.11 
 
 
5929 aa  1709    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3477  amino acid adenylation domain-containing protein  34.11 
 
 
1745 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0634623  normal  0.144372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  33.91 
 
 
3432 aa  1258    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.51 
 
 
4531 aa  1952    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.16 
 
 
2385 aa  1202    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  27.23 
 
 
2345 aa  702    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  38.19 
 
 
2385 aa  1203    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  37.72 
 
 
2385 aa  1202    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.1 
 
 
3133 aa  702    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  38.5 
 
 
3328 aa  1399    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  32.15 
 
 
4186 aa  800    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  32.48 
 
 
3021 aa  951    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  32.12 
 
 
4336 aa  1078    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  35.49 
 
 
2154 aa  996    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  28.46 
 
 
1568 aa  655    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  32.86 
 
 
3165 aa  1169    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  35.43 
 
 
5926 aa  1685    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  33.85 
 
 
9498 aa  1907    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  34.53 
 
 
5372 aa  1824    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  32.95 
 
 
5469 aa  1504    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  34.57 
 
 
13537 aa  1909    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  34.86 
 
 
6676 aa  2044    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1865  amino acid adenylation  52.12 
 
 
1344 aa  899    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1866  amino acid adenylation  46.96 
 
 
1074 aa  695    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.996538  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  43.86 
 
 
3629 aa  1368    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  28.98 
 
 
2867 aa  714    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  33.85 
 
 
2791 aa  847    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  37.2 
 
 
1142 aa  658    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  36.04 
 
 
3308 aa  1719    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  32.11 
 
 
3498 aa  1122    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  38.01 
 
 
2033 aa  765    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  29.05 
 
 
3395 aa  824    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  33.6 
 
 
6274 aa  1520    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.46 
 
 
4239 aa  713    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  35.22 
 
 
6072 aa  1803    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  34.55 
 
 
4572 aa  1800    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  37.05 
 
 
3291 aa  1561    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  40.07 
 
 
5654 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  33.75 
 
 
4502 aa  1059    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  34.12 
 
 
2136 aa  849    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  33.31 
 
 
5422 aa  1568    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  33.21 
 
 
4882 aa  1474    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  32.47 
 
 
3002 aa  981    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  32.5 
 
 
4332 aa  1101    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  35.16 
 
 
3219 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.16 
 
 
2385 aa  1202    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  36.21 
 
 
4037 aa  1114    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  37.45 
 
 
3348 aa  1571    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  33.65 
 
 
6272 aa  1518    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  32.46 
 
 
3650 aa  696    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  38.27 
 
 
1726 aa  808    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  39.46 
 
 
4290 aa  1809    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  39.48 
 
 
4489 aa  2027    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  42.21 
 
 
2605 aa  1249    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  27 
 
 
2410 aa  817    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  31.71 
 
 
3102 aa  1066    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  34.31 
 
 
3180 aa  681    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1177  amino acid adenylation  24.9 
 
 
3137 aa  683    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3534  amino acid adenylation  27.47 
 
 
2457 aa  668    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  36.06 
 
 
3231 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3466  amino acid adenylation  34.59 
 
 
1745 aa  645    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1084  non-ribosomal peptide synthetase modules and related proteins-like protein  29.86 
 
 
2638 aa  652    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  36.16 
 
 
3227 aa  656    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  36.91 
 
 
3176 aa  926    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  33.31 
 
 
3018 aa  639    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  35.28 
 
 
6081 aa  1817    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  34.59 
 
 
2352 aa  754    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  34.27 
 
 
4342 aa  1032    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  37.11 
 
 
5149 aa  1191    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  36.81 
 
 
2189 aa  1036    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  37.38 
 
 
2448 aa  1103    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  36.8 
 
 
3524 aa  1350    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  36.06 
 
 
3231 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  32.27 
 
 
2151 aa  778    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3529  amino acid adenylation domain-containing protein  34.59 
 
 
1745 aa  645    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3845  amino acid adenylation domain-containing protein  34.12 
 
 
1721 aa  655    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549835  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2696  amino acid adenylation domain-containing protein  35.09 
 
 
1762 aa  674    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502345  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  30.28 
 
 
2199 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.19 
 
 
3127 aa  701    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  38.46 
 
 
3352 aa  1396    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  29.32 
 
 
2138 aa  920    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  34.37 
 
 
4468 aa  1786    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  32.04 
 
 
3291 aa  1389    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  33.65 
 
 
6271 aa  1519    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  35.43 
 
 
6006 aa  1773    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>