More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3693 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  32.69 
 
 
4317 aa  723    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  34.86 
 
 
6176 aa  728    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  33.07 
 
 
3470 aa  729    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  34.11 
 
 
2174 aa  741    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  32.53 
 
 
4317 aa  713    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  32.78 
 
 
3639 aa  681    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  32.29 
 
 
5467 aa  656    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  34.56 
 
 
5953 aa  794    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  36.76 
 
 
6889 aa  940    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.54 
 
 
2385 aa  1266    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  31.1 
 
 
4336 aa  785    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  34.34 
 
 
2151 aa  837    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  31.5 
 
 
3168 aa  667    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  33.93 
 
 
5929 aa  723    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  37.07 
 
 
6999 aa  794    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  29.89 
 
 
3432 aa  751    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  32.53 
 
 
4531 aa  866    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.86 
 
 
2385 aa  1246    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  34.09 
 
 
2155 aa  717    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  33.8 
 
 
2385 aa  1255    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  33.51 
 
 
2385 aa  1255    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  37.17 
 
 
3328 aa  842    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  25.32 
 
 
4080 aa  657    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  32.68 
 
 
3021 aa  706    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3063  amino acid adenylation domain-containing protein  33.26 
 
 
5620 aa  802    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.384616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  34.35 
 
 
8646 aa  801    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  31.05 
 
 
4336 aa  787    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  35.26 
 
 
2154 aa  850    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  32.59 
 
 
3165 aa  643    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  33.91 
 
 
5926 aa  715    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  31.2 
 
 
9498 aa  755    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  33.84 
 
 
5372 aa  806    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  32.74 
 
 
5469 aa  679    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  32.42 
 
 
13537 aa  792    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  31.97 
 
 
6676 aa  837    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  35.83 
 
 
6661 aa  791    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  38.6 
 
 
3629 aa  826    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  28.67 
 
 
2867 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1780  amino acid adenylation domain-containing protein  28.67 
 
 
1922 aa  708    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276348  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  34.11 
 
 
2137 aa  688    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  30 
 
 
3308 aa  865    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  31.54 
 
 
3498 aa  743    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  33.33 
 
 
2386 aa  1257    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  35.64 
 
 
1726 aa  684    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  28.37 
 
 
2138 aa  789    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  32.51 
 
 
3291 aa  888    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  37.23 
 
 
6072 aa  844    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  32.57 
 
 
4572 aa  741    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  34.25 
 
 
3291 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  28.42 
 
 
3395 aa  661    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  32.69 
 
 
4502 aa  759    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  34.39 
 
 
3331 aa  709    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  30.69 
 
 
2136 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  32.74 
 
 
5422 aa  664    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  33.63 
 
 
4882 aa  773    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  32.92 
 
 
3002 aa  735    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.54 
 
 
2385 aa  1263    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  29.78 
 
 
3942 aa  669    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  31.81 
 
 
4332 aa  791    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  34.05 
 
 
4342 aa  735    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  34.51 
 
 
3348 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.86 
 
 
2385 aa  1246    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  31.39 
 
 
4037 aa  699    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  35.39 
 
 
8914 aa  858    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  31.99 
 
 
1714 aa  726    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  31.24 
 
 
4317 aa  748    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  34.83 
 
 
4991 aa  748    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  39.59 
 
 
4290 aa  884    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  39.26 
 
 
4489 aa  1004    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  35.08 
 
 
2605 aa  760    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  32.01 
 
 
4468 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  33.01 
 
 
3102 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  28.5 
 
 
6404 aa  696    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2961  amino acid adenylation domain-containing protein  33.9 
 
 
2201 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956293  hitchhiker  0.00505571 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  33.8 
 
 
5596 aa  842    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  37.11 
 
 
2125 aa  770    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  33.14 
 
 
2386 aa  1196    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  32.1 
 
 
5328 aa  759    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  33.57 
 
 
5230 aa  708    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  35.62 
 
 
2370 aa  864    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  32.8 
 
 
8915 aa  638    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  34.99 
 
 
3176 aa  755    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  33.1 
 
 
2352 aa  667    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  34.28 
 
 
4342 aa  740    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  33.37 
 
 
5149 aa  797    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  34.25 
 
 
2189 aa  722    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  35.92 
 
 
2448 aa  897    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  34.61 
 
 
3524 aa  863    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  32.55 
 
 
4317 aa  724    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  28.2 
 
 
2151 aa  672    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  29.04 
 
 
2894 aa  723    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  38.46 
 
 
7785 aa  897    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  29 
 
 
2156 aa  791    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  37.17 
 
 
3352 aa  842    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.46 
 
 
4968 aa  799    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  32.75 
 
 
4383 aa  736    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  31.89 
 
 
6271 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  37.19 
 
 
6006 aa  843    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  31.84 
 
 
6272 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2570  amino acid adenylation domain-containing protein  28.55 
 
 
3114 aa  671    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0117255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>