More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2719 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  40.11 
 
 
2614 aa  706    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  30.42 
 
 
4960 aa  1042    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2522  non-ribosomal peptide synthase  31.98 
 
 
2979 aa  741    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207691  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  33.4 
 
 
3231 aa  952    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  30.48 
 
 
2596 aa  843    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6558  non-ribosomal peptide synthase  38.27 
 
 
4106 aa  1248    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  32.36 
 
 
2628 aa  883    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  32.13 
 
 
4317 aa  889    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  32.88 
 
 
5230 aa  1176    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  34.17 
 
 
4136 aa  1300    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  36.19 
 
 
7310 aa  1088    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  32.79 
 
 
5213 aa  1006    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  31.48 
 
 
4336 aa  919    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2148  pyoverdine sidechain peptide synthetase II, D-Asp-L-Thr component  33.91 
 
 
2625 aa  863    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307821  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1322  amino acid adenylation domain protein  35.7 
 
 
2877 aa  1164    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  32.38 
 
 
2875 aa  984    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1875  amino acid adenylation domain-containing protein  32.21 
 
 
1990 aa  851    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  33.48 
 
 
6176 aa  897    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2719  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 
3410 aa  6514    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  36.96 
 
 
5750 aa  1096    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1715  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  25.01 
 
 
2543 aa  799    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1716  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  24.46 
 
 
3044 aa  778    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1717  multifunctional nonribosomal peptide synthetase (mycosubtilin synthetase)  26.25 
 
 
2295 aa  751    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3733  amino acid adenylation domain protein  34.23 
 
 
2855 aa  1115    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1615  amino acid adenylation domain-containing protein  35.68 
 
 
3221 aa  785    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0566356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  33.62 
 
 
5467 aa  1200    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2575  non-ribosomal peptide synthase  31.39 
 
 
2979 aa  731    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  32.55 
 
 
4342 aa  889    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  31.94 
 
 
4336 aa  907    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  34.55 
 
 
2666 aa  764    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1960  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  32.84 
 
 
2883 aa  976    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.77716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  40.96 
 
 
1315 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1558  amino acid adenylation domain-containing protein  35.81 
 
 
3227 aa  781    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.765691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  33.55 
 
 
4991 aa  1032    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  27.79 
 
 
3086 aa  774    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1598  amino acid adenylation domain-containing protein  35.97 
 
 
3219 aa  791    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546873 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.6 
 
 
4968 aa  977    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20780  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  61.48 
 
 
3539 aa  3664    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.040794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  39.24 
 
 
7541 aa  718    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  39.87 
 
 
3629 aa  1368    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2569  amino acid adenylation domain-containing protein  32.28 
 
 
2971 aa  754    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188555 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  28.17 
 
 
2006 aa  700    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  32.26 
 
 
2845 aa  855    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0024  linear gramicidin synthetase subunit D  26.81 
 
 
3374 aa  647    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  29.57 
 
 
3498 aa  720    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  30.43 
 
 
2033 aa  779    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  33.29 
 
 
3962 aa  775    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1494  amino acid adenylation domain protein  35.75 
 
 
2846 aa  1181    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2663  nonribosomal peptide synthetase  31.59 
 
 
2979 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  33.36 
 
 
2606 aa  939    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  32.6 
 
 
3235 aa  830    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2574  amino acid adenylation domain-containing protein  29 
 
 
6404 aa  990    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  30.65 
 
 
4960 aa  1046    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  32.48 
 
 
5654 aa  1225    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  31.56 
 
 
4502 aa  967    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  35.09 
 
 
3208 aa  870    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  38.86 
 
 
6999 aa  720    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  34.1 
 
 
3247 aa  668    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  31.85 
 
 
4332 aa  919    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  36.08 
 
 
3219 aa  796    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  29.5 
 
 
9175 aa  1169    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  32.29 
 
 
4037 aa  1044    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  24.75 
 
 
4080 aa  910    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  31.88 
 
 
4317 aa  887    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1956  non-ribosomal peptide synthetase, putative  32.71 
 
 
2967 aa  777    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  31.73 
 
 
3650 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  34.19 
 
 
3296 aa  808    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  38.04 
 
 
4290 aa  640    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3733  amino acid adenylation domain protein  33.84 
 
 
11233 aa  904    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  33.02 
 
 
7712 aa  959    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2461  amino acid adenylation  37.94 
 
 
4606 aa  1384    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.782467 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  32.94 
 
 
3180 aa  838    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5189  amino acid adenylation domain protein  28.29 
 
 
6202 aa  1086    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018726 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  35.64 
 
 
3231 aa  803    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  27.88 
 
 
3086 aa  774    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  35.13 
 
 
3227 aa  771    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  32.2 
 
 
3176 aa  682    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  31.64 
 
 
3018 aa  900    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  32.18 
 
 
4317 aa  905    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  32.8 
 
 
5328 aa  973    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  32.44 
 
 
4342 aa  895    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  34.14 
 
 
5149 aa  1008    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  31.68 
 
 
3432 aa  950    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  33.8 
 
 
3224 aa  889    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4072  amino acid adenylation domain protein  33.08 
 
 
3230 aa  873    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753138 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  35.64 
 
 
3231 aa  803    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  29.96 
 
 
2883 aa  839    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  39.62 
 
 
3710 aa  917    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3732  amino acid adenylation domain protein  36.58 
 
 
6113 aa  903    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3730  amino acid adenylation domain-containing protein  36.13 
 
 
2651 aa  939    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.390082 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  32.77 
 
 
3404 aa  862    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  32.02 
 
 
3942 aa  1008    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  32.89 
 
 
4318 aa  873    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  32.21 
 
 
2878 aa  927    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  34.01 
 
 
3018 aa  904    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  32.48 
 
 
4317 aa  883    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  35.13 
 
 
2626 aa  1015    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  26.48 
 
 
3395 aa  923    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  32.16 
 
 
4747 aa  971    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  34.03 
 
 
2561 aa  631  1e-179  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>