More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2725 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6968  non-ribosomal peptide synthetase  66.61 
 
 
599 aa  761    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2725  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
588 aa  1177    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0175538  normal  0.742433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  49.57 
 
 
1315 aa  515  1e-144  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  49.91 
 
 
3710 aa  503  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6556  siderophore 2,3-dihydroxybenzoate (DHB) synthesis protein  50 
 
 
1305 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416947  hitchhiker  0.00000457979 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  49.39 
 
 
2605 aa  492  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  48.85 
 
 
4290 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1746  amino acid adenylation domain protein  46.37 
 
 
3223 aa  465  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  48.87 
 
 
8211 aa  458  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  42.69 
 
 
2561 aa  453  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  44.92 
 
 
3247 aa  451  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5582  putative nonribosomal peptide synthetase (NPRS)  44.75 
 
 
1654 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344509  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  39.93 
 
 
627 aa  435  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  39.93 
 
 
1069 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  39.93 
 
 
1093 aa  434  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  40.48 
 
 
2386 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.33 
 
 
2385 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.82 
 
 
2385 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.27 
 
 
2385 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.67 
 
 
2385 aa  413  1e-114  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  40.99 
 
 
3308 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4309  amino acid adenylation domain protein  42.93 
 
 
2577 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.867052 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  37.59 
 
 
2385 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.5 
 
 
2385 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  38.98 
 
 
2385 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  43.34 
 
 
7310 aa  409  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  38.5 
 
 
2385 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  46.94 
 
 
4489 aa  412  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  38.67 
 
 
2385 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  39.24 
 
 
1689 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  37.88 
 
 
2386 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  44.21 
 
 
3639 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2461  amino acid adenylation  45.9 
 
 
4606 aa  401  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.782467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  39.17 
 
 
5596 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  41.11 
 
 
1110 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  43.72 
 
 
7785 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  40.07 
 
 
3761 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  35.25 
 
 
1078 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20780  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  43.05 
 
 
3539 aa  389  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.040794 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  38.71 
 
 
1142 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  42.04 
 
 
2370 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  41.85 
 
 
1769 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  39.9 
 
 
1776 aa  388  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  43.73 
 
 
3629 aa  386  1e-106  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  38.93 
 
 
4037 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  41.23 
 
 
1498 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  40.31 
 
 
6176 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  39.26 
 
 
2151 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  38.77 
 
 
5738 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  39.35 
 
 
1317 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  37.05 
 
 
2581 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  41.03 
 
 
1839 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  38.63 
 
 
3331 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  41.52 
 
 
6889 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  37.14 
 
 
1753 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  38.29 
 
 
1714 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  37.98 
 
 
2666 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  39.05 
 
 
2154 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5064  amino acid adenylation domain protein  43.12 
 
 
4449 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  35.15 
 
 
888 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  41.28 
 
 
8914 aa  379  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  37.8 
 
 
2606 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  38.46 
 
 
5654 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  39.53 
 
 
2626 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  36.66 
 
 
1518 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  41.99 
 
 
8646 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1117  nonribosomal peptide synthetase DhbF  41.79 
 
 
1082 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  38.46 
 
 
2273 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  36.66 
 
 
1518 aa  379  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0269  nonribosomal peptide synthetase DhbF  41.53 
 
 
1082 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3031  amino acid adenylation domain protein  35.24 
 
 
1466 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1704  non-ribosomal peptide synthase  41.53 
 
 
1082 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2696  amino acid adenylation domain-containing protein  41.61 
 
 
1762 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502345  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  42.61 
 
 
4478 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3845  amino acid adenylation domain-containing protein  40.91 
 
 
1721 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549835  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1287  nonribosomal peptide synthetase DhbF  41.79 
 
 
1082 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0118  nonribosomal peptide synthetase DhbF  41.79 
 
 
1071 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0308  nonribosomal peptide synthetase DhbF  41.79 
 
 
1082 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  38.05 
 
 
5213 aa  373  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  38.52 
 
 
4336 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2150  pyoverdine sidechain peptide synthetase IV, D-Asp-L-Ser component  38.47 
 
 
2875 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4495  amino acid adenylation domain protein  43.25 
 
 
559 aa  374  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  39.19 
 
 
2439 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3090  amino acid adenylation domain protein  34.9 
 
 
1466 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  37.8 
 
 
3291 aa  375  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  46.14 
 
 
1726 aa  375  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  34.97 
 
 
1336 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  38.31 
 
 
5328 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1791  non-ribosomal peptide synthase  41.36 
 
 
1082 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4895  amino acid adenylation domain-containing protein  44.52 
 
 
1035 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  38.13 
 
 
4336 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  39.9 
 
 
13537 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  37.75 
 
 
4502 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  39.49 
 
 
1789 aa  370  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2948  amino acid adenylation domain-containing protein  38.22 
 
 
1057 aa  369  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.735724  normal  0.0141341 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  36.27 
 
 
1518 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  39.45 
 
 
5149 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  43.8 
 
 
7541 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  39.02 
 
 
2845 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  39.83 
 
 
2137 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>