More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1704 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1704  amino acid adenylation  100 
 
 		 1322 aa  2714    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.410435 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5752  amino acid adenylation domain protein  32.59 
 
 		 1069 aa  419  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4833  amino acid adenylation  38.92 
 
 		 627 aa  406  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.954107  normal  0.0358179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  32.89 
 
 		 5738 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  33.37 
 
 		 1093 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  37.85 
 
 		 2370 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  37.08 
 
 		 1142 aa  389  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  36.43 
 
 		 6676 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  37.58 
 
 		 5929 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  35.72 
 
 		 2561 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1881  amino acid adenylation domain-containing protein  35.64 
 
 		 1689 aa  371  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  37.41 
 
 		 9175 aa  366  1e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  36.65 
 
 		 8646 aa  364  8e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1972  amino acid adenylation domain-containing protein  36.54 
 
 		 3018 aa  363  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  35.16 
 
 		 3639 aa  363  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  36.71 
 
 		 5372 aa  362  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  35.1 
 
 		 9498 aa  361  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5871  amino acid adenylation domain protein  29.31 
 
 		 1078 aa  360  8e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.126486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2948  amino acid adenylation domain-containing protein  34.82 
 
 		 1057 aa  358  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.735724  normal  0.0141341 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  35.13 
 
 		 5596 aa  357  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  35.92 
 
 		 13537 aa  352  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3091  amino acid adenylation domain protein  30.23 
 
 		 1870 aa  352  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  39.51 
 
 		 5926 aa  352  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  34.63 
 
 		 1779 aa  351  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  36.9 
 
 		 5422 aa  350  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3030  amino acid adenylation domain protein  30.46 
 
 		 1870 aa  349  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.05 
 
 		 4968 aa  348  3e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  35.6 
 
 		 4882 aa  348  3e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2570  amino acid adenylation domain-containing protein  29.63 
 
 		 3114 aa  347  8e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117255 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3399  amino acid adenylation domain protein  34.67 
 
 		 7122 aa  346  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163726 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  36.32 
 
 		 5953 aa  345  2.9999999999999997e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  33.53 
 
 		 2573 aa  344  5e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  29.54 
 
 		 3086 aa  344  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  29.54 
 
 		 3086 aa  344  5.999999999999999e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  29 
 
 		 4960 aa  343  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  37.27 
 
 		 5469 aa  343  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  28.69 
 
 		 4960 aa  342  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  34.04 
 
 		 1786 aa  343  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  32.35 
 
 		 1776 aa  342  4e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  30.15 
 
 		 7168 aa  340  9e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.08 
 
 		 2385 aa  339  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  33.23 
 
 		 2385 aa  338  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5582  putative nonribosomal peptide synthetase (NPRS)  34.92 
 
 		 1654 aa  337  5.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  34.16 
 
 		 1769 aa  337  7e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  36.62 
 
 		 3710 aa  337  7e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1965  amino acid adenylation domain-containing protein  32.23 
 
 		 2439 aa  337  7.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229236 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0023  linear gramicidin synthetase subunit B  32.97 
 
 		 2681 aa  336  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  34.77 
 
 		 7712 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.83 
 
 		 2385 aa  336  2e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  32.58 
 
 		 2385 aa  335  4e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  32.73 
 
 		 2385 aa  335  4e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.78 
 
 		 2385 aa  335  5e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.78 
 
 		 2385 aa  335  5e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.58 
 
 		 2385 aa  335  5e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2329  amino acid adenylation domain protein  28.39 
 
 		 2752 aa  333  9e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  31.59 
 
 		 2614 aa  333  9e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  34.1 
 
 		 4531 aa  333  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4895  amino acid adenylation domain-containing protein  37.11 
 
 		 1035 aa  332  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  38.79 
 
 		 2454 aa  332  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  31.26 
 
 		 3498 aa  332  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  31.47 
 
 		 3176 aa  332  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  37.05 
 
 		 1726 aa  333  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2725  amino acid adenylation domain-containing protein  37.76 
 
 		 588 aa  332  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0175538  normal  0.742433 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1248  amino acid adenylation domain protein  35.6 
 
 		 653 aa  332  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2461  linear gramicidin synthetase subunit C  33.79 
 
 		 1518 aa  332  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  31.29 
 
 		 3308 aa  331  6e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  34.89 
 
 		 1110 aa  331  7e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  34.13 
 
 		 6072 aa  331  7e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5619  amino acid adenylation domain-containing protein  32.88 
 
 		 1518 aa  331  7e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0824  amino acid adenylation domain protein  32.05 
 
 		 1449 aa  330  8e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0591001 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4495  amino acid adenylation domain protein  36.28 
 
 		 559 aa  330  9e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.793634  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  33.63 
 
 		 3328 aa  330  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  34.09 
 
 		 2386 aa  330  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  33.98 
 
 		 6081 aa  330  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  33.63 
 
 		 3352 aa  330  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  34.13 
 
 		 6006 aa  330  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1934  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  31.46 
 
 		 1280 aa  329  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2875  linear gramicidin synthetase subunit C  33.69 
 
 		 1518 aa  329  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  30.02 
 
 		 2867 aa  328  3e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  34.31 
 
 		 6889 aa  328  5e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3855  amino acid adenylation  34.13 
 
 		 888 aa  327  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  32.08 
 
 		 2385 aa  327  8.000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  29.85 
 
 		 2006 aa  327  1e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  29.26 
 
 		 1556 aa  326  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4101  amino acid adenylation  29.74 
 
 		 1345 aa  326  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357734  normal  0.611275 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  29.05 
 
 		 1556 aa  326  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  28.26 
 
 		 3235 aa  326  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  30.5 
 
 		 3453 aa  325  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1680  amino acid adenylation domain-containing protein  30.95 
 
 		 1405 aa  325  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  33.56 
 
 		 2387 aa  325  4e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  33.05 
 
 		 6176 aa  325  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1849  amino acid adenylation  31.09 
 
 		 1383 aa  324  9.000000000000001e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1888  amino acid adenylation domain protein  31.94 
 
 		 1315 aa  323  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0349547  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  32.23 
 
 		 2386 aa  323  9.999999999999999e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6556  siderophore 2,3-dihydroxybenzoate (DHB) synthesis protein  36.78 
 
 		 1305 aa  323  9.999999999999999e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416947  hitchhiker  0.00000457979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  34.09 
 
 		 3331 aa  322  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  27.86 
 
 		 2164 aa  323  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0370  amino acid adenylation domain protein  30.18 
 
 		 4090 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  33.08 
 
 		 3291 aa  322  3.9999999999999996e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0362  amino acid adenylation domain-containing protein  31.54 
 
 		 2350 aa  321  5e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.197157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>