More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2267 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  33 
 
 		 5953 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  32.75 
 
 		 6889 aa  644    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  26.46 
 
 		 3235 aa  770    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  33.03 
 
 		 5929 aa  659    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  31.28 
 
 		 3432 aa  662    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  31.06 
 
 		 4186 aa  754    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1794  amino acid adenylation  71.49 
 
 		 3064 aa  4246    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.206481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  33.58 
 
 		 5926 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  33.7 
 
 		 5372 aa  679    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  31.87 
 
 		 6676 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  32.21 
 
 		 3308 aa  712    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.9 
 
 		 2370 aa  681    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  31.19 
 
 		 4239 aa  709    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  33.02 
 
 		 3002 aa  675    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2267  amino acid adenylation  100 
 
 		 3031 aa  6134    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.962511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3892  amino acid adenylation domain protein  46.77 
 
 		 2827 aa  2223    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  35.1 
 
 		 8211 aa  699    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  32.2 
 
 		 3021 aa  635  1e-180  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  32.24 
 
 		 6403 aa  631  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  32.77 
 
 		 9498 aa  632  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  30.14 
 
 		 7168 aa  627  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  29.77 
 
 		 5738 aa  613  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  31.63 
 
 		 4531 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  29.71 
 
 		 4960 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  27.68 
 
 		 2054 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  32.1 
 
 		 4882 aa  603  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.74 
 
 		 4968 aa  602  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  29.66 
 
 		 4960 aa  600  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  27.6 
 
 		 4196 aa  594  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  31.41 
 
 		 13537 aa  591  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  28.65 
 
 		 2164 aa  592  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  30.59 
 
 		 1714 aa  592  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  30.51 
 
 		 4502 aa  590  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  28.76 
 
 		 3291 aa  587  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  30.7 
 
 		 2386 aa  588  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  31.12 
 
 		 5596 aa  590  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  31.61 
 
 		 3348 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  31.55 
 
 		 3291 aa  586  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  29.64 
 
 		 2386 aa  582  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.67 
 
 		 2385 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.7 
 
 		 2385 aa  580  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  31.32 
 
 		 2189 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.12 
 
 		 8646 aa  576  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.64 
 
 		 2385 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  29.63 
 
 		 2385 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.23 
 
 		 2385 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.5 
 
 		 2385 aa  576  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  29.37 
 
 		 3498 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.64 
 
 		 2385 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  31.11 
 
 		 8914 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  28.55 
 
 		 3086 aa  572  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  29.71 
 
 		 2385 aa  573  1e-161  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  28.49 
 
 		 3086 aa  571  1e-161  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  31.26 
 
 		 4572 aa  573  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  27.86 
 
 		 2193 aa  571  1e-161  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  29.96 
 
 		 2561 aa  574  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.41 
 
 		 2385 aa  568  1e-160  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  32.1 
 
 		 2137 aa  570  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5582  putative nonribosomal peptide synthetase (NPRS)  31.81 
 
 		 1654 aa  570  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  30.94 
 
 		 4468 aa  567  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  31.15 
 
 		 5328 aa  567  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  28.52 
 
 		 2156 aa  567  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  31.18 
 
 		 7785 aa  567  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  28.67 
 
 		 2156 aa  564  1e-158  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  32.27 
 
 		 2614 aa  561  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  30.12 
 
 		 6081 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  27.88 
 
 		 3695 aa  560  1e-157  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  30.43 
 
 		 6072 aa  560  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  31.14 
 
 		 2448 aa  558  1e-157  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  26.47 
 
 		 4080 aa  556  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3419  amino acid adenylation domain protein  28.89 
 
 		 3453 aa  552  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  29.1 
 
 		 2156 aa  551  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  31.97 
 
 		 7310 aa  553  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  31.48 
 
 		 4318 aa  551  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  30.67 
 
 		 3761 aa  548  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  27.6 
 
 		 9175 aa  549  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  31.26 
 
 		 5213 aa  546  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  31.89 
 
 		 4747 aa  546  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  31.04 
 
 		 3176 aa  546  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  31.96 
 
 		 5750 aa  541  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  32.65 
 
 		 3639 aa  543  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  30.73 
 
 		 6006 aa  540  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2570  amino acid adenylation domain-containing protein  26.24 
 
 		 3114 aa  540  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  30.99 
 
 		 5149 aa  537  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  29.57 
 
 		 2571 aa  534  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  29.39 
 
 		 2573 aa  533  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  29.57 
 
 		 2571 aa  533  1e-149  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  28.69 
 
 		 2581 aa  533  1e-149  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  31 
 
 		 4991 aa  533  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  30.16 
 
 		 2151 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  30.67 
 
 		 5422 aa  530  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  30.76 
 
 		 4332 aa  529  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  30.99 
 
 		 4342 aa  530  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  31.09 
 
 		 3331 aa  527  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  29.99 
 
 		 4336 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  30.93 
 
 		 3328 aa  527  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  30.26 
 
 		 2154 aa  527  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  29.99 
 
 		 4317 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  30.93 
 
 		 3352 aa  526  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  29.77 
 
 		 3102 aa  526  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>