More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1794 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3892  amino acid adenylation domain protein  45.71 
 
 
2827 aa  2170    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  31.05 
 
 
4186 aa  749    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  32.3 
 
 
3021 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1794  amino acid adenylation  100 
 
 
3064 aa  6209    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.206481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  32.89 
 
 
5372 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  31.64 
 
 
3308 aa  691    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  32.36 
 
 
2370 aa  679    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  33.73 
 
 
8211 aa  683    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2267  amino acid adenylation  71.46 
 
 
3031 aa  4295    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.962511  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  26.87 
 
 
3235 aa  747    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  32.35 
 
 
3002 aa  635  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  32.42 
 
 
5929 aa  631  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  31.1 
 
 
3432 aa  633  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  31.99 
 
 
5953 aa  623  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  31.69 
 
 
6403 aa  620  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  31.15 
 
 
6676 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  32.31 
 
 
5926 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  31.74 
 
 
6889 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  30.93 
 
 
4531 aa  599  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  29.61 
 
 
7168 aa  600  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  28.84 
 
 
4960 aa  592  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  29 
 
 
4968 aa  593  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  29 
 
 
4960 aa  592  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  28.68 
 
 
5738 aa  588  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  28.66 
 
 
2385 aa  590  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  29.95 
 
 
2561 aa  590  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  26.71 
 
 
2054 aa  590  1e-166  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  31.05 
 
 
9498 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  28.66 
 
 
2164 aa  585  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  28.42 
 
 
2156 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.21 
 
 
2385 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  28.88 
 
 
3291 aa  586  1.0000000000000001e-165  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  29.16 
 
 
2386 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.86 
 
 
2385 aa  582  1e-164  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.87 
 
 
2385 aa  582  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.92 
 
 
2385 aa  582  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.6 
 
 
2385 aa  582  1e-164  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  30.91 
 
 
8914 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  31.51 
 
 
7785 aa  578  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.21 
 
 
2385 aa  577  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  28.03 
 
 
2385 aa  576  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.21 
 
 
2385 aa  577  1.0000000000000001e-162  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  27.18 
 
 
4196 aa  575  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  30.93 
 
 
2448 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  28.42 
 
 
2386 aa  577  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  27.69 
 
 
2193 aa  577  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5582  putative nonribosomal peptide synthetase (NPRS)  31.91 
 
 
1654 aa  577  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344509  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  31.43 
 
 
3291 aa  573  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  31.01 
 
 
4502 aa  573  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  31.57 
 
 
3348 aa  574  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  30.73 
 
 
3761 aa  572  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  31.9 
 
 
2189 aa  571  1e-161  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  31.69 
 
 
2614 aa  568  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  30.75 
 
 
8646 aa  567  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  30.85 
 
 
2151 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  31.13 
 
 
4336 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  31.64 
 
 
2154 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  27.61 
 
 
2156 aa  566  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  30.94 
 
 
4882 aa  562  1e-158  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  30.94 
 
 
5596 aa  562  1e-158  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  28.06 
 
 
9175 aa  561  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  31.32 
 
 
4747 aa  558  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  28.9 
 
 
1714 aa  561  1e-157  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  28.05 
 
 
2156 aa  556  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  26.4 
 
 
4080 aa  552  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  28.69 
 
 
3498 aa  553  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  31.14 
 
 
4572 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  31.67 
 
 
4332 aa  552  1e-155  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  31.35 
 
 
5328 aa  553  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  30.03 
 
 
13537 aa  550  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  31.01 
 
 
4468 aa  550  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  30.26 
 
 
4336 aa  544  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  31.36 
 
 
4318 aa  543  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  30.68 
 
 
7310 aa  542  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  31.21 
 
 
6081 aa  540  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  30.93 
 
 
6072 aa  539  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  31.72 
 
 
3639 aa  538  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  31.81 
 
 
4342 aa  540  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  31.19 
 
 
1726 aa  537  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  31.69 
 
 
4342 aa  535  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  30.88 
 
 
4317 aa  533  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  31.93 
 
 
5750 aa  531  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4754  amino acid adenylation domain-containing protein  31.57 
 
 
3331 aa  532  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  30.28 
 
 
5213 aa  528  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  30.05 
 
 
3176 aa  530  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  31.34 
 
 
2137 aa  526  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  27.58 
 
 
3086 aa  526  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  27.39 
 
 
3086 aa  525  1e-147  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  26.53 
 
 
3695 aa  522  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  28.96 
 
 
2571 aa  521  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  34.13 
 
 
2273 aa  523  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  28.96 
 
 
2571 aa  522  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  30.85 
 
 
4991 aa  523  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4307  amino acid adenylation domain protein  30.76 
 
 
3247 aa  522  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.39871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  29.43 
 
 
6661 aa  521  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  30.57 
 
 
6006 aa  520  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  35.19 
 
 
3335 aa  519  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  30.82 
 
 
5149 aa  520  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  29.88 
 
 
2573 aa  515  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  32.65 
 
 
2176 aa  515  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>