More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3892 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  31.16 
 
 		 4186 aa  663    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1794  amino acid adenylation  45.52 
 
 		 3064 aa  2185    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.206481 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  31.16 
 
 		 3308 aa  642    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  32.97 
 
 		 4239 aa  657    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2267  amino acid adenylation  46.8 
 
 		 3031 aa  2243    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.962511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3892  amino acid adenylation domain protein  100 
 
 		 2827 aa  5525    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  28.22 
 
 		 3235 aa  633  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  33.47 
 
 		 2370 aa  621  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  30.81 
 
 		 3432 aa  597  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  35.03 
 
 		 8211 aa  576  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5190  amino acid adenylation domain protein  29.64 
 
 		 7168 aa  576  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000112945 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  32.29 
 
 		 3021 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  33.03 
 
 		 6403 aa  570  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  32.39 
 
 		 3002 aa  570  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32.59 
 
 		 5953 aa  567  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  30.05 
 
 		 5738 aa  561  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  26.96 
 
 		 2054 aa  550  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  31.98 
 
 		 6676 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  27.07 
 
 		 4196 aa  542  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  29.21 
 
 		 4968 aa  538  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  28.5 
 
 		 2193 aa  533  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  29.46 
 
 		 4960 aa  526  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  29.36 
 
 		 4960 aa  524  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.28 
 
 		 8646 aa  519  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  28.12 
 
 		 3291 aa  520  1.0000000000000001e-145  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  31.72 
 
 		 6889 aa  514  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  29.4 
 
 		 4502 aa  517  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  32.61 
 
 		 2176 aa  517  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  31.2 
 
 		 5929 aa  513  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  31.64 
 
 		 3176 aa  512  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.88 
 
 		 2385 aa  509  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  30.2 
 
 		 4747 aa  508  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  27.55 
 
 		 3498 aa  510  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  30 
 
 		 2151 aa  506  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  30.09 
 
 		 5213 aa  505  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  29.83 
 
 		 2154 aa  506  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.89 
 
 		 2385 aa  506  1e-141  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  27.55 
 
 		 2156 aa  505  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  28.03 
 
 		 2156 aa  504  1e-141  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  30.95 
 
 		 4317 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.83 
 
 		 2385 aa  505  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  26.48 
 
 		 2164 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  30.72 
 
 		 5926 aa  502  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  30.41 
 
 		 9498 aa  502  1e-140  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  28.88 
 
 		 2386 aa  501  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.88 
 
 		 2385 aa  499  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  31.03 
 
 		 8914 aa  500  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  31.29 
 
 		 3348 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.91 
 
 		 2385 aa  497  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  30.08 
 
 		 5596 aa  496  9.999999999999999e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  29.09 
 
 		 2386 aa  496  9.999999999999999e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.91 
 
 		 2385 aa  497  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  26.2 
 
 		 3086 aa  497  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  28.61 
 
 		 2385 aa  496  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  28.7 
 
 		 2385 aa  493  1e-137  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  28.74 
 
 		 2385 aa  492  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  31.18 
 
 		 5372 aa  493  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  30.65 
 
 		 4317 aa  492  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  29.43 
 
 		 2561 aa  489  1e-136  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  30.98 
 
 		 3291 aa  490  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  25.91 
 
 		 3086 aa  491  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  30.5 
 
 		 5149 aa  489  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  32.46 
 
 		 6072 aa  484  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  27.32 
 
 		 2156 aa  484  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  27.64 
 
 		 2581 aa  485  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5065  amino acid adenylation domain protein  34.27 
 
 		 2333 aa  488  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7298  peptide synthetase  29.56 
 
 		 2573 aa  485  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  32.42 
 
 		 6006 aa  487  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  30.6 
 
 		 4317 aa  484  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  32.01 
 
 		 3328 aa  483  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  30.63 
 
 		 4317 aa  482  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1784  amino acid adenylation domain-containing protein  25.73 
 
 		 4080 aa  484  1e-134  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  31.95 
 
 		 6081 aa  482  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18410  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  32.3 
 
 		 7310 aa  484  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  32.01 
 
 		 3352 aa  483  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1887  amino acid adenylation domain protein  31.96 
 
 		 2614 aa  482  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  30.84 
 
 		 5328 aa  478  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  32.39 
 
 		 4183 aa  479  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  30.89 
 
 		 4531 aa  476  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5582  putative nonribosomal peptide synthetase (NPRS)  32.16 
 
 		 1654 aa  477  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  35.68 
 
 		 3335 aa  477  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5191  amino acid adenylation domain protein  28.19 
 
 		 9175 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.233499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4562  amino acid adenylation domain-containing protein  30.21 
 
 		 7785 aa  476  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21020  putative non-ribosomal peptide synthetase  32.14 
 
 		 2352 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  32.55 
 
 		 3639 aa  478  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  30.77 
 
 		 4572 aa  473  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  30.82 
 
 		 4882 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2378  amino acid adenylation domain protein  26.32 
 
 		 3695 aa  471  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  33.53 
 
 		 2273 aa  471  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3541  amino acid adenylation domain-containing protein  30.89 
 
 		 2137 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.432696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  28.68 
 
 		 3470 aa  466  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  30.53 
 
 		 4468 aa  467  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  26.47 
 
 		 2387 aa  463  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1780  amino acid adenylation domain-containing protein  25.74 
 
 		 1922 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276348  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  29.83 
 
 		 4332 aa  464  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  29.74 
 
 		 4336 aa  459  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  29.7 
 
 		 13537 aa  459  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  32.36 
 
 		 1726 aa  460  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  30.8 
 
 		 6661 aa  459  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  30.37 
 
 		 2448 aa  457  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>