57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6193 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6193  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2730  Methyltransferase type 12  55.22 
 
 		 207 aa  228  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294095  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4629  hypothetical protein  55.5 
 
 		 206 aa  227  8e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2423  hypothetical protein  56.5 
 
 		 223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1362  methyltransferase type 12  51.74 
 
 		 206 aa  215  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4066  hypothetical protein  56.63 
 
 		 294 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63470  putative methyltransferase  55.5 
 
 		 205 aa  207  7e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.42526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4379  hypothetical protein  55 
 
 		 206 aa  206  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4843  methyltransferase type 12  54.12 
 
 		 205 aa  201  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6933  hypothetical protein  48.51 
 
 		 207 aa  198  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  50.25 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0157  hypothetical protein  53.3 
 
 		 204 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4355  hypothetical protein  54.69 
 
 		 194 aa  195  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.051926  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2344  Methyltransferase type 12  50.25 
 
 		 205 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.499373 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2103  Methyltransferase type 12  49.75 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0971  methyltransferase type 12  46.63 
 
 		 210 aa  184  8e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2989  methyltransferase type 12  40.1 
 
 		 206 aa  184  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.563154  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0485  SAM binding protein  55.56 
 
 		 209 aa  184  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2231  Methyltransferase type 12  47.21 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.487897 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2603  hypothetical protein  47.21 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  31.4 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  28.3 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  27.14 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 273 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 239 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  32.18 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  36.11 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  32.33 
 
 		 268 aa  45.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 261 aa  45.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3413  Methyltransferase type 12  26.18 
 
 		 255 aa  45.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  20.25 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  20.25 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  20.25 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  20.25 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  20.25 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  32 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  20.25 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  34.19 
 
 		 218 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.76 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 248 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1967  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  20.25 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  24.34 
 
 		 267 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  27.59 
 
 		 269 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 248 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  27.52 
 
 		 285 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  31.5 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  19.62 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  22.15 
 
 		 236 aa  42  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.16 
 
 		 155 aa  41.6  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 216 aa  41.2  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  22.54 
 
 		 277 aa  41.2  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>