66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2603 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2603  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2231  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 203 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.487897 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2423  hypothetical protein  49.24 
 
 		 223 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1362  methyltransferase type 12  48.97 
 
 		 206 aa  208  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4066  hypothetical protein  51.02 
 
 		 294 aa  208  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4843  methyltransferase type 12  50.26 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63470  putative methyltransferase  49.74 
 
 		 205 aa  205  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.42526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0157  hypothetical protein  47.18 
 
 		 204 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4629  hypothetical protein  47.72 
 
 		 206 aa  186  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  46.53 
 
 		 209 aa  184  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2103  Methyltransferase type 12  47.72 
 
 		 205 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6193  hypothetical protein  47.21 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2730  Methyltransferase type 12  42.5 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2344  Methyltransferase type 12  44.67 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.499373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2989  methyltransferase type 12  39.09 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.563154  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4379  hypothetical protein  45.69 
 
 		 206 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4355  hypothetical protein  46.11 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.051926  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0971  methyltransferase type 12  40.59 
 
 		 210 aa  152  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6933  hypothetical protein  40.5 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0485  SAM binding protein  46.52 
 
 		 209 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.57 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  26.87 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.09 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 243 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  25.49 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  27.33 
 
 		 235 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  32.53 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1645  methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 281 aa  45.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  23.44 
 
 		 269 aa  45.4  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.47 
 
 		 264 aa  45.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  26.32 
 
 		 258 aa  45.1  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1799  hypothetical protein  24.03 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.378794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1329  dimethyladenosine transferase  26.47 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000282219  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2292  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 267 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 275 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 328 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 339 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  27.21 
 
 		 238 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  27.69 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  26.67 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1357  dimethyladenosine transferase  26.47 
 
 		 260 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000735455  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  26.83 
 
 		 285 aa  43.1  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 305 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 249 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4409  methyltransferase type 11  25.89 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 305 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  22.43 
 
 		 315 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 295 aa  42.4  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.91 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2594  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 262 aa  42  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  25.86 
 
 		 246 aa  42  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 202 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0484  hypothetical protein  25 
 
 		 138 aa  42  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.873682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1007  O-methyltransferase family 2  29.32 
 
 		 311 aa  42  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000712761 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2762  hypothetical protein  22.32 
 
 		 209 aa  42  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103169 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 235 aa  42  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 284 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 197 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 327 aa  41.6  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 197 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 		 271 aa  41.2  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 240 aa  41.2  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1199  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  23.78 
 
 		 372 aa  41.2  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.420763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>