79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_63470 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_63470  putative methyltransferase  100 
 
 
205 aa  416  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.42526  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2423  hypothetical protein  62.56 
 
 
223 aa  257  8e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1362  methyltransferase type 12  59.61 
 
 
206 aa  254  9e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4066  hypothetical protein  60 
 
 
294 aa  249  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4843  methyltransferase type 12  58.62 
 
 
205 aa  246  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0157  hypothetical protein  59.3 
 
 
204 aa  228  7e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  51.47 
 
 
209 aa  214  9e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6193  hypothetical protein  55.5 
 
 
204 aa  207  7e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2231  Methyltransferase type 12  49.74 
 
 
203 aa  205  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.487897 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2603  hypothetical protein  49.74 
 
 
203 aa  205  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4629  hypothetical protein  51.52 
 
 
206 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2103  Methyltransferase type 12  50.25 
 
 
205 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2730  Methyltransferase type 12  49.49 
 
 
207 aa  191  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2344  Methyltransferase type 12  49.01 
 
 
205 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.499373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2989  methyltransferase type 12  38.24 
 
 
206 aa  178  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.563154  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4379  hypothetical protein  51.01 
 
 
206 aa  178  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6933  hypothetical protein  42.72 
 
 
207 aa  174  8e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4355  hypothetical protein  52.38 
 
 
194 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.051926  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0485  SAM binding protein  50.8 
 
 
209 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0971  methyltransferase type 12  39.71 
 
 
210 aa  138  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  28.08 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
283 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  25.47 
 
 
236 aa  52  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  29.12 
 
 
243 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 
246 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  26.09 
 
 
236 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  26.09 
 
 
236 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  25.9 
 
 
236 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  26.09 
 
 
236 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 
202 aa  48.5  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  32.03 
 
 
235 aa  48.5  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  25.47 
 
 
236 aa  48.5  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  25.47 
 
 
236 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  23.9 
 
 
222 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.07 
 
 
213 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 
286 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2810  methyltransferase type 12  35.65 
 
 
207 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 
261 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2026  Methyltransferase type 11  28.91 
 
 
261 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508606  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
208 aa  45.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2038  Methyltransferase type 11  20.99 
 
 
197 aa  45.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.678124 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
249 aa  45.1  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 
240 aa  45.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  22.58 
 
 
267 aa  44.7  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  27.93 
 
 
212 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16550  predicted protein  29.87 
 
 
266 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00695626  normal  0.185291 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  31.46 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.15 
 
 
259 aa  44.3  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  24.22 
 
 
236 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  27.2 
 
 
265 aa  44.3  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.59 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  29.94 
 
 
238 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1799  hypothetical protein  23.03 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.378794  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
305 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.55 
 
 
253 aa  43.5  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
305 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  30.08 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1654  methyltransferase type 11  34.45 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.190237  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1203  hypothetical protein  20.56 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.322275  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.71 
 
 
299 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1324  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3102  methyltransferase type 11  21.35 
 
 
292 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  25.35 
 
 
271 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  30.34 
 
 
249 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1007  O-methyltransferase family 2  29.63 
 
 
311 aa  42.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000712761 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
245 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  23.24 
 
 
242 aa  42.4  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  23.68 
 
 
258 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
207 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  29.21 
 
 
249 aa  41.6  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  29.81 
 
 
225 aa  41.6  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  29.21 
 
 
249 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1601  methyltransferase type 11  31.46 
 
 
286 aa  41.6  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.192236 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  29.21 
 
 
249 aa  41.6  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  29.21 
 
 
249 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  29.21 
 
 
249 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  23.27 
 
 
199 aa  41.2  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0954  methyltransferase type 12  23.42 
 
 
343 aa  41.2  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>