89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2730 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2730  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 207 aa  420  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294095  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4629  hypothetical protein  57.77 
 
 		 206 aa  250  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6193  hypothetical protein  55.22 
 
 		 204 aa  228  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4379  hypothetical protein  55.83 
 
 		 206 aa  226  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.686834  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4355  hypothetical protein  56.48 
 
 		 194 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.051926  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2423  hypothetical protein  51 
 
 		 223 aa  207  8e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1362  methyltransferase type 12  49.01 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0485  SAM binding protein  57.84 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2103  Methyltransferase type 12  48.76 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0373513 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2344  Methyltransferase type 12  47 
 
 		 205 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.499373 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63470  putative methyltransferase  49.49 
 
 		 205 aa  191  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.42526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4066  hypothetical protein  50.51 
 
 		 294 aa  191  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0356205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0120  Methyltransferase type 12  46.57 
 
 		 209 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6933  hypothetical protein  44.16 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2231  Methyltransferase type 12  42.5 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.487897 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2603  hypothetical protein  42.5 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.329351  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2989  methyltransferase type 12  35.92 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.563154  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4843  methyltransferase type 12  44.9 
 
 		 205 aa  171  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0157  hypothetical protein  44.28 
 
 		 204 aa  168  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.376043 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0971  methyltransferase type 12  40 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  22.47 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  22.47 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.34 
 
 		 257 aa  51.6  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4574  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.29 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.14 
 
 		 258 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2258  methyltransferase type 12  22.8 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0351185 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.39 
 
 		 257 aa  48.5  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 256 aa  48.9  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1383  thiopurine S-methyltransferase  26.67 
 
 		 198 aa  48.5  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0875719  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.35 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  27.73 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  30.39 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1799  hypothetical protein  24.68 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.378794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4471  methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00423193 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.43 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  25.56 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.71 
 
 		 256 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7221  putative 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.94 
 
 		 241 aa  45.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.77 
 
 		 255 aa  45.4  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.02 
 
 		 258 aa  45.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.89 
 
 		 256 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.02 
 
 		 258 aa  45.1  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.02 
 
 		 258 aa  45.1  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 239 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  28.66 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  32.38 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  33.33 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2081  thiopurine S-methyltransferase  24.68 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.858928  normal  0.891479 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.89 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.01 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1461  Methyltransferase type 11  24.31 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  27.04 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  29.23 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.5 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.96 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.96 
 
 		 261 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.32 
 
 		 293 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  28.26 
 
 		 344 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  35.79 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0301  Methyltransferase type 12  29.03 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.5 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0378  thiopurine S-methyltransferase  35.29 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.15 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.41 
 
 		 201 aa  42.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.85 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0193  methyltransferase type 12  26.37 
 
 		 198 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.111686 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  30.39 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  29.7 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0186  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  33.72 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  33.72 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.26 
 
 		 256 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0197  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.85 
 
 		 262 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.11 
 
 		 262 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0462  hypothetical protein  28.76 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  27.98 
 
 		 182 aa  42  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 258 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.78 
 
 		 258 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 337 aa  41.2  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>