More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9102 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9102  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  56.65 
 
 
853 aa  296  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3829  Methyltransferase type 11  56.32 
 
 
264 aa  287  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0702  methyltransferase type 11  36.92 
 
 
265 aa  158  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136876  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0760  methyltransferase type 11  36.92 
 
 
265 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481453  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2851  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 
270 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3689  Methyltransferase type 12  37.1 
 
 
270 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00200869  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5566  methyltransferase type 12  38.06 
 
 
267 aa  139  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.509991  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4137  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 
265 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50382  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  36.73 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2575  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9239  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.85 
 
 
263 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7789  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  34.87 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  31.36 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  34.46 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 
267 aa  62.8  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
278 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1020  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 
273 aa  60.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.833494 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03556  conserved hypothetical protein  30.1 
 
 
390 aa  59.3  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.879656 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3542  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35 
 
 
243 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3694  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00559242  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
273 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  26.97 
 
 
219 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.06 
 
 
287 aa  56.6  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.54 
 
 
285 aa  56.2  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  29.88 
 
 
269 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0650  methyltransferase type 11  30.94 
 
 
424 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  0.369974 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3622  methyltransferase type 11  37.17 
 
 
243 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.932817  normal  0.0502026 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0957  Methyltransferase type 11  25 
 
 
218 aa  54.7  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.89 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0321  demethylmenaquinone methyltransferase  34.09 
 
 
216 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.728843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
280 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5461  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.2 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127944  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
215 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.1 
 
 
209 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  34.72 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  35.2 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  30.18 
 
 
272 aa  54.7  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  28.4 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  30.34 
 
 
270 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05091  hypothetical protein  28.48 
 
 
334 aa  53.1  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  27.14 
 
 
208 aa  53.1  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
276 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2754  Methyltransferase type 12  27.14 
 
 
260 aa  52.8  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  23.03 
 
 
280 aa  52.8  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1055  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase  29.36 
 
 
218 aa  52.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.265378 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  28.93 
 
 
249 aa  52.8  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
287 aa  52.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0672  putative RNA methylase  26.22 
 
 
282 aa  52.8  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  29.14 
 
 
286 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  28.66 
 
 
246 aa  52.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  31.2 
 
 
246 aa  52.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02165  TAM domain methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G15860)  36 
 
 
373 aa  52  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0475648  normal  0.123223 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  36.13 
 
 
267 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.91 
 
 
285 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.8 
 
 
243 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28603  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  39.29 
 
 
239 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.08 
 
 
246 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000587821  hitchhiker  0.0091617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0458  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.12 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.886741 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  27.93 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.87 
 
 
248 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  33.04 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  27.89 
 
 
284 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0069  demethylmenaquinone methyltransferase  26.26 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  30.32 
 
 
196 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0333  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.12 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744081  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0348  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.12 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.43472 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  29.66 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05416  conserved hypothetical protein  24.37 
 
 
280 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.953808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2290  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 
226 aa  50.4  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4117  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  27.41 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.930509  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.12 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0887672  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1422  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.12 
 
 
229 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.91 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.996518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
283 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.4 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184412  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  22.78 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  31.4 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2732  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.4 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.183201  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2759  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.91 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
269 aa  50.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
272 aa  50.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2726  putative methyltransferase  35.14 
 
 
82 aa  50.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.607127  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.32 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2783  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.4 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2650  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.4 
 
 
243 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.067766  normal  0.282604 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05874  hypothetical protein  30.26 
 
 
284 aa  49.7  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.813771 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  27.04 
 
 
313 aa  49.7  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  35 
 
 
275 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  26.4 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  19.9 
 
 
234 aa  49.7  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
237 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0567  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.21 
 
 
243 aa  49.3  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.309496  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.42 
 
 
201 aa  49.3  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1291  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  26.67 
 
 
243 aa  49.3  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.250358  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  32.09 
 
 
210 aa  49.3  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>