More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0760 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0760  methyltransferase type 11  100 
 
 
265 aa  538  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481453  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0702  methyltransferase type 11  82.26 
 
 
265 aa  454  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136876  normal  0.144201 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3829  Methyltransferase type 11  37.55 
 
 
264 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 
853 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2851  Methyltransferase type 11  34.87 
 
 
270 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9102  hypothetical protein  36.92 
 
 
268 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4137  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.50382  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3689  Methyltransferase type 12  33.46 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00200869  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2762  putative methyltransferase  33.47 
 
 
288 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.778358 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2575  Methyltransferase type 11  31.66 
 
 
264 aa  102  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9239  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.95 
 
 
263 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5566  methyltransferase type 12  29.77 
 
 
267 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.509991  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7789  Methyltransferase type 11  28.75 
 
 
276 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.527057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  28.24 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 
276 aa  63.5  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0391  methyltransferase type 11  30.88 
 
 
278 aa  62  0.000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 
263 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
279 aa  60.5  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  29.01 
 
 
208 aa  60.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1471  putative methyltransferase  28.73 
 
 
431 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.65 
 
 
266 aa  59.7  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1559  putative methyltransferase  28.73 
 
 
370 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0056  methyltransferase small domain-containing protein  28.73 
 
 
438 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0610921  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0786  hypothetical protein  26.04 
 
 
242 aa  58.9  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.27206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  31.52 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.54 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  29.51 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4416  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  37.07 
 
 
1014 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1973  demethylmenaquinone methyltransferase  34.95 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3349  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 
145 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3415  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.5 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3675  methyltransferase type 11  35.2 
 
 
287 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7199  methyltransferase type 11  28.28 
 
 
278 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375023  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.19 
 
 
248 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.54 
 
 
287 aa  56.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3735  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
245 aa  56.2  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286886  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  22.75 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.17 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.32 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  35.38 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  31.75 
 
 
288 aa  54.7  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  34.23 
 
 
313 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.46 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  23.17 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.96 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  27.54 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  22.54 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  33.01 
 
 
267 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.46 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
208 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
210 aa  53.9  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 
265 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.46 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.94 
 
 
272 aa  53.9  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2859  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.51 
 
 
287 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.28 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 
295 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
1039 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.41 
 
 
268 aa  53.1  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.27 
 
 
201 aa  52.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
225 aa  53.1  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
273 aa  53.1  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  29.25 
 
 
392 aa  52.4  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  27.15 
 
 
242 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.12 
 
 
259 aa  52.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1636  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
261 aa  52.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  31.2 
 
 
267 aa  52.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  21.23 
 
 
251 aa  52  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0672  putative RNA methylase  24.65 
 
 
282 aa  52  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  22.77 
 
 
259 aa  52  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  21.79 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0294  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  21.79 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00915266  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2339  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
191 aa  51.6  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.755854  normal  0.422901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1100  methyltransferase type 11  29.89 
 
 
313 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  25 
 
 
168 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0215  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  24.85 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303919 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
286 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1351  methyltransferase type 11  32.17 
 
 
217 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.884704  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0348  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.22 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.43472 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0323  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  22.78 
 
 
251 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.22 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28603  normal  0.449931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3804  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154752  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0333  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.22 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.744081  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.32 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  26.67 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0458  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.54 
 
 
243 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.886741 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.19 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  28.65 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3178  methyltransferase type 11  32.37 
 
 
239 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.184817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3694  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00559242  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2754  Methyltransferase type 12  27.71 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  21.43 
 
 
260 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0431  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.54 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0887672  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  30 
 
 
271 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>