80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6244 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6244  Methyltransferase type 11  100 
 
 
326 aa  660    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.099736  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  30.39 
 
 
313 aa  113  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  32.95 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 
313 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0900  hypothetical protein  34.3 
 
 
313 aa  99.4  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  32.79 
 
 
727 aa  97.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
252 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2700  hypothetical protein  29.63 
 
 
312 aa  86.7  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000485808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  28.05 
 
 
553 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  30.95 
 
 
701 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000456443 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  31.43 
 
 
701 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  29.69 
 
 
699 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  26.67 
 
 
701 aa  80.1  0.00000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  29.77 
 
 
700 aa  79.3  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  31.68 
 
 
702 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  29.69 
 
 
699 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  31.07 
 
 
726 aa  77  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  30.73 
 
 
709 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  29.69 
 
 
699 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  26.83 
 
 
696 aa  75.9  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  29.69 
 
 
699 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000228556 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  30.21 
 
 
705 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  29.69 
 
 
704 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0125  hypothetical protein  32.47 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  29.69 
 
 
704 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  29.69 
 
 
704 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  29.69 
 
 
704 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  28.97 
 
 
716 aa  73.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  33.77 
 
 
709 aa  72  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  29.38 
 
 
702 aa  69.3  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  29.38 
 
 
702 aa  69.3  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1366  methyltransferase type 11  20.42 
 
 
288 aa  65.1  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  27.2 
 
 
252 aa  65.1  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  28.19 
 
 
933 aa  59.3  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  29.68 
 
 
722 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.65 
 
 
243 aa  53.5  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 
284 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 
239 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  31.5 
 
 
282 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  22.06 
 
 
747 aa  49.3  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  28.82 
 
 
259 aa  49.3  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.07 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1747  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.044533  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  27.15 
 
 
238 aa  47.4  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 
226 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  27.22 
 
 
703 aa  47  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  32.06 
 
 
289 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  23.66 
 
 
213 aa  46.6  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  28.5 
 
 
267 aa  45.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  23.29 
 
 
248 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 
241 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  26.71 
 
 
255 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  21.89 
 
 
339 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
327 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  28.69 
 
 
278 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  25.5 
 
 
240 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  29.01 
 
 
243 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 
225 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  27.03 
 
 
243 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  29.38 
 
 
328 aa  44.3  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  25.81 
 
 
241 aa  44.3  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  28.14 
 
 
295 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 
257 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  26.52 
 
 
261 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 
271 aa  44.3  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  28.23 
 
 
241 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  28.06 
 
 
301 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.64 
 
 
265 aa  43.5  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  33.91 
 
 
429 aa  43.1  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  27.46 
 
 
290 aa  42.7  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
283 aa  42.7  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 
251 aa  42.7  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30 
 
 
268 aa  42.7  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  30 
 
 
225 aa  42.4  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
268 aa  42.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>