More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2633 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  57.68 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  56.85 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  56.43 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  56.43 
 
 		 248 aa  272  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  38.33 
 
 		 243 aa  201  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2877  methyltransferase type 12  43.33 
 
 		 240 aa  188  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0377935 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  34.43 
 
 		 244 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3822  methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  35.86 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  36.22 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3055  methyltransferase type 11  35.86 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000014304  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  42.35 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 		 237 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  33.17 
 
 		 276 aa  110  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3306  Methyltransferase type 11  29.64 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  30.8 
 
 		 311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  30.56 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5370  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 288 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.328033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  32.92 
 
 		 288 aa  95.1  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0962  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 242 aa  93.2  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0942  Methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 249 aa  93.2  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000927283 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4625  hypothetical protein  35.52 
 
 		 237 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.394037  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6131  UbiE Methyltransferase type 11  30.33 
 
 		 289 aa  91.7  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5629  Methyltransferase type 12  29.03 
 
 		 263 aa  87  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879577  normal  0.697867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1757  methylase  29.22 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1461  hypothetical protein  34.43 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.321475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1003  hypothetical protein  34.43 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175729  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3322  methyltransferase type 12  32.81 
 
 		 318 aa  87  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.595734  normal  0.302163 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1485  hypothetical protein  34.43 
 
 		 237 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.38639  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1368  hypothetical protein  32.46 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1408  hypothetical protein  34.78 
 
 		 237 aa  85.1  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1380  hypothetical protein  42.86 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  29.19 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  35.15 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  35.65 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3939  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136325 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 		 519 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4536  methyltransferase type 12  31.94 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561367 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 		 711 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1376  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.331989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  31.98 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1057  putative pristinamycin I synthase 3  31.72 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00377731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5899  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.331708  normal  0.516672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 		 527 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  30.46 
 
 		 531 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  30.46 
 
 		 527 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3413  Methyltransferase type 12  25.3 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0397  Methyltransferase type 12  32.06 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4115  methyltransferase type 12  29.19 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  31.19 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0388  Methyltransferase type 12  32.06 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0292  MCP methyltransferase, CheR-type  25.6 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0533  type 12 methyltransferase  31.51 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324241  decreased coverage  0.00341349 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  29.94 
 
 		 710 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2551  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 240 aa  62  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.57 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0944  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  29.88 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1427  methyltransferase type 12  26.21 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  28.82 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 289 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  27.45 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0093  methyltransferase type 12  32.09 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.222843  normal  0.108853 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  26.49 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08180  methyltransferase family protein  27.54 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  29.72 
 
 		 624 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  25.64 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  26.39 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  34.06 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7221  putative 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.04 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1180  methyltransferase type 11  34.26 
 
 		 279 aa  55.5  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  30 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  34.82 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 634 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.11 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5773  Methyltransferase type 12  34.29 
 
 		 303 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  27.64 
 
 		 349 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.91 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  28.82 
 
 		 255 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6137  methyltransferase UbiE  26.4 
 
 		 290 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  25.34 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  30.6 
 
 		 358 aa  53.5  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001927  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE/COQ5  27.91 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>