More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2180 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2180  putative methyltransferase  100 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  46.32 
 
 		 241 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  45.57 
 
 		 241 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  46.32 
 
 		 241 aa  191  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  44.87 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  44.87 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  44.87 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  34.2 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1805  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.440612  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  31.37 
 
 		 241 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2990  methyltransferase type 11  34.05 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.30741  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  31.74 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2336  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2104  Methyltransferase type 11  30.8 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0094319  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3199  Methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291582  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0846  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  32.37 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  31.89 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  34.44 
 
 		 276 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  35.92 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  27.09 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 259 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25940  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.96 
 
 		 282 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  27 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  42.72 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0687  hypothetical protein  27.23 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0656  hypothetical protein  25.85 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241729  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  32.34 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  29.56 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 268 aa  74.7  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5523  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  39.66 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0529  methyltransferase  27.54 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.67 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  37.5 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  39.06 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0585  hypothetical protein  27.35 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0619  hypothetical protein  27.35 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  27.67 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  32.95 
 
 		 252 aa  72  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 269 aa  72  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4681  hypothetical protein  24.88 
 
 		 243 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740312  hitchhiker  1.6173199999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  32 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1966  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 274 aa  70.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.670216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  28.63 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  33.15 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20210  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.44 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal  0.219584 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0529  methyltransferase  27.67 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0533  methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  31.15 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1513  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.280949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.58 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.23 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2876  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  32 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  33 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6455  methyltransferase type 11  31.32 
 
 		 316 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00745461 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1721  methyltransferase type 11  37.29 
 
 		 309 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0157757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  31.84 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.72 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  41.51 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  34.06 
 
 		 224 aa  67  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 303 aa  67  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  31 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  31 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2198  Methyltransferase type 11  34.36 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.59 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  31 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  41.51 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  31 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  31 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2949  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212824  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.78 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  29.83 
 
 		 362 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.27 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3678  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  30.9 
 
 		 274 aa  65.5  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 259 aa  65.5  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.78 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  32.74 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  41.35 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3035  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 286 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000393102  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  31 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.84 
 
 		 265 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>