More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4383 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_4383  methyltransferase type 11  100 
 
 
237 aa  475  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000226186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3416  methyltransferase  53.64 
 
 
249 aa  249  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2223  methyltransferase type 11  51.61 
 
 
293 aa  231  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128403  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3227  methyltransferase  42.79 
 
 
254 aa  155  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1721  methyltransferase  39.09 
 
 
234 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.501367 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2172  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.52 
 
 
266 aa  93.2  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.942434  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  33 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
365 aa  75.5  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  43.14 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.61 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.41 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.41 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2414  hypothetical protein  34.87 
 
 
351 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.177274  normal  0.0190439 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  33.6 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.78 
 
 
215 aa  62.8  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.07 
 
 
261 aa  62.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4431  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 
315 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.184386 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4986  predicted protein  28.92 
 
 
239 aa  62  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.778509 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.11 
 
 
241 aa  62  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4369  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 
315 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  29.79 
 
 
306 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 
263 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.63 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0806  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  26.83 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.622934  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0149  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.74 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.05 
 
 
240 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2500  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
221 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126168  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2158  methyltransferase type 11  32.39 
 
 
363 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0217452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
204 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10291  methyltransferase  29.93 
 
 
352 aa  59.3  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.55915 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.61 
 
 
233 aa  59.3  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  35.95 
 
 
357 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
204 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  32.2 
 
 
204 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.87 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.13 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6252  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.78 
 
 
251 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 
305 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 
305 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  27.11 
 
 
304 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1272  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  44.29 
 
 
228 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1204  generic methyl-transferase  35.17 
 
 
363 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  26.21 
 
 
363 aa  55.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.26 
 
 
234 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
262 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1339  methyltransferase type 11  27.13 
 
 
220 aa  55.5  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  28.37 
 
 
351 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.71 
 
 
211 aa  55.5  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.228971 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.84 
 
 
266 aa  55.5  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.88 
 
 
249 aa  55.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
363 aa  55.5  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1836  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  27.15 
 
 
246 aa  55.5  0.0000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.47 
 
 
262 aa  55.1  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07721  methyltransferase  32.87 
 
 
353 aa  55.1  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0608577 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0542  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  28.48 
 
 
261 aa  55.1  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  30.63 
 
 
236 aa  55.1  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4511  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  31.82 
 
 
250 aa  55.1  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1338  Methyltransferase type 11  36.29 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00439312  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.5 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0140  methyltransferase  32.87 
 
 
353 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0872  hypothetical protein  31.58 
 
 
316 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0354264  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3130  hypothetical protein  25.53 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1236  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.34 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.228899  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4209  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.92 
 
 
248 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.5 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3945  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.5 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
204 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  31.51 
 
 
347 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1317  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.57 
 
 
263 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.6507  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.45 
 
 
202 aa  53.9  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0998  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  27.27 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  32.43 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4056  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.06 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4009  type 11 methyltransferase  31.87 
 
 
319 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.63 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.74 
 
 
232 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.34 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  29.27 
 
 
204 aa  53.5  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  32.41 
 
 
293 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.34 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3572  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.19 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000345623 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1266  generic methyl-transferase  31.48 
 
 
357 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.95 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3792  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.73 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0059  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.4 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.802877  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2995  Methyltransferase type 11  30.57 
 
 
363 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482606  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3373  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.8 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4247  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.06 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.225644  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1004  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.84 
 
 
247 aa  53.1  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.202483  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.11 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2670  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.86 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4367  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.03 
 
 
258 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00822046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
330 aa  52.8  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1347  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.97 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1233  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
526 aa  53.1  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.153132  normal  0.111718 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2205  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
362 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000273998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3725  demethylmenaquinone methyltransferase  30.4 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>