More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3751 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3751  Methyltransferase type 11  100 
 
 
243 aa  481  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0386  methyltransferase  34.21 
 
 
225 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  32.62 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2594  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
262 aa  85.9  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.71 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1269  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0711  Methyltransferase type 11  32.76 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0787386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  34.11 
 
 
254 aa  72  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.56 
 
 
233 aa  72  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.34 
 
 
256 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.34 
 
 
256 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  47.93 
 
 
237 aa  72  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  39.26 
 
 
222 aa  71.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.34 
 
 
256 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.73 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.73 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  37.72 
 
 
283 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  40.5 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 
365 aa  68.6  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.29 
 
 
305 aa  68.6  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 
284 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.93 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0597  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  35.66 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.369183  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  37.01 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  32.12 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.12 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.53 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  35.54 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  39.67 
 
 
284 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.52 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.93 
 
 
256 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  34.75 
 
 
279 aa  65.1  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  37.32 
 
 
276 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
286 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.04 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  39.84 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.67 
 
 
232 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.93 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
282 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.11 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.78 
 
 
213 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  40.34 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
271 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  35.07 
 
 
238 aa  63.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
276 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0746  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.05 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0103  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.75 
 
 
249 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.881721  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  37.01 
 
 
261 aa  62.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1375  hypothetical protein  27.54 
 
 
196 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.38 
 
 
234 aa  62.4  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0400  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
248 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.555595  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.62 
 
 
261 aa  62.4  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 
255 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.78 
 
 
254 aa  62  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  37.21 
 
 
331 aa  62  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  31.95 
 
 
282 aa  61.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.38 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.8 
 
 
280 aa  61.2  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 
317 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4297  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.38 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  37.4 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2700  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  30.92 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000274083 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.25 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4178  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.38 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.962772  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4250  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.38 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.81268  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  34.96 
 
 
266 aa  61.6  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  40.18 
 
 
382 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  35.77 
 
 
279 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4357  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.38 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2432  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.61 
 
 
260 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  34.4 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  34.27 
 
 
267 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2593  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.17 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00547032  decreased coverage  0.0000000226487 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  26.28 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0016  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  26.28 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.15 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1030  methyltransferase type 12  28.86 
 
 
200 aa  60.5  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.225567  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1591  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.74 
 
 
221 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00562  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.03 
 
 
259 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.52 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  28.35 
 
 
219 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  31.69 
 
 
265 aa  60.1  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4209  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.71 
 
 
266 aa  60.1  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  36.72 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  36.22 
 
 
320 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.66 
 
 
325 aa  59.7  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 
281 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  34.86 
 
 
196 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  38.21 
 
 
280 aa  59.7  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4146  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.09 
 
 
251 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4354  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.09 
 
 
251 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.09 
 
 
251 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.123369  normal  0.211011 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4175  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.09 
 
 
251 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>