181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6101 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6101  methyltransferase type 11  100 
 
 		 214 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2380  methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.220714  hitchhiker  0.00193582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.6 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  26.14 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  29.53 
 
 		 282 aa  55.5  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  26.77 
 
 		 254 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.21 
 
 		 255 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 283 aa  51.6  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0002  glucose-inhibited division protein B  31.3 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.189717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2182  hypothetical protein  29.1 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.378961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  26.57 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3309  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  36.19 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.260983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  26.27 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0636  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.24189  normal  0.300979 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3284  hypothetical protein  29.1 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 281 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  25.76 
 
 		 254 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.92 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3621  hypothetical protein  27.61 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3788  type 11 methyltransferase  27.27 
 
 		 306 aa  49.7  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4460  hypothetical protein  27.61 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3906  hypothetical protein  27.61 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  26 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0859  QbsJ-like methyltransferase  25.17 
 
 		 366 aa  48.9  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.226018  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1783  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 300 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  26.14 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  28.32 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3800  hypothetical protein  28.36 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 254 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.59 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  33.65 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0560  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.33 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  29.37 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.45 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  24.73 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3790  methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.27 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 275 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  36.07 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  25.21 
 
 		 400 aa  46.6  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 267 aa  46.6  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5242  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 255 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 255 aa  46.2  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  27.27 
 
 		 253 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 276 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  26.13 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25.49 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  26.21 
 
 		 287 aa  45.8  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0198  methyltransferase type 11  25.36 
 
 		 217 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0695927  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.83 
 
 		 269 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 300 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  25.47 
 
 		 285 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  24.81 
 
 		 270 aa  45.8  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.25 
 
 		 256 aa  45.4  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1064  O-methyltransferase family 2  32.77 
 
 		 368 aa  45.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 256 aa  45.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  29.66 
 
 		 252 aa  45.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2161  Methyltransferase type 12  26.89 
 
 		 237 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.135573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 275 aa  45.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 265 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.7 
 
 		 256 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.27 
 
 		 256 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 281 aa  45.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  20.99 
 
 		 211 aa  45.1  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4714  hypothetical protein  28.89 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0213695 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25 
 
 		 282 aa  45.1  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2354  methyltransferase type 11  24.6 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.202193  normal  0.578326 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 247 aa  45.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  25.35 
 
 		 310 aa  45.1  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  27.44 
 
 		 274 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  29.41 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2653  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.57 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  26.09 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  29.41 
 
 		 261 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  27.92 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  25.62 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  26.25 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3544  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.51858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12009  hypothetical protein  30.28 
 
 		 282 aa  44.3  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.25 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3301  hypothetical protein  23.94 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.163975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 273 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  31.07 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4874  methyltransferase type 12  28.23 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983195  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4963  methyltransferase type 12  28.23 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 259 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0777  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.621905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 285 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  24.84 
 
 		 309 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>