53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2380 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2380  methyltransferase type 11  100 
 
 
450 aa  905    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.220714  hitchhiker  0.00193582 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6101  methyltransferase type 11  31.87 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.372421  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.45 
 
 
205 aa  56.6  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
200 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
200 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  32.85 
 
 
629 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4299  methyltransferase type 11  40.52 
 
 
266 aa  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
330 aa  51.6  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
337 aa  50.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2049  methyltransferase type 11  38.05 
 
 
266 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  34.23 
 
 
267 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
341 aa  50.1  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 
199 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  30.41 
 
 
341 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  39.8 
 
 
276 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
317 aa  48.5  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
238 aa  48.5  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1183  methyltransferase type 11  27.88 
 
 
179 aa  47.4  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.275985  normal  0.0518629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
337 aa  47.8  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  27.61 
 
 
202 aa  47  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4407  methyltransferase type 11  35.4 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.424506  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  32.02 
 
 
241 aa  45.8  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1570  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.41 
 
 
233 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.375212  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 
268 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  30.28 
 
 
213 aa  46.2  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 
268 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  35.43 
 
 
309 aa  46.2  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  34.75 
 
 
255 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1153  hypothetical protein  26.42 
 
 
469 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1774  methyltransferase type 11  34.34 
 
 
261 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.80867 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0954  hypothetical protein  21.76 
 
 
428 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.438042  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
328 aa  45.8  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  40.37 
 
 
232 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  29.82 
 
 
310 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.43 
 
 
201 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0457  methyltransferase type 11  33.94 
 
 
208 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
173 aa  44.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3569  Methyltransferase type 11  37.06 
 
 
259 aa  44.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  25.56 
 
 
274 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  35.4 
 
 
265 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1178  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
186 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.140989 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  34.67 
 
 
305 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0402  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.58 
 
 
254 aa  43.9  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.866144  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1783  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 
300 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  32.61 
 
 
331 aa  43.9  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  24.11 
 
 
344 aa  44.3  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 
283 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  32.62 
 
 
349 aa  43.9  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0809  demethylmenaquinone methyltransferase  37.84 
 
 
233 aa  43.5  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0380502  hitchhiker  0.00800437 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.77 
 
 
244 aa  43.1  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3544  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
247 aa  43.1  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.51858  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5061  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
252 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  29.82 
 
 
263 aa  43.1  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>